龙眼mir159家族成员进化特性及时空表达-应用与环境生物学报.pdfVIP

龙眼mir159家族成员进化特性及时空表达-应用与环境生物学报.pdf

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2017-08-25 DOI: 10.3724/SP.J.1145.2017.03011 / Chin J Appl Environ Biol 2017 23 ( 4 ) : 0602-0608 应用与环境生物学报 , 龙眼miR159家族成员进化特性及时空表达* ** 陈旭 曾友竞 王嘉毅 陈晓慧 徐小萍 李汉生 张梓浩 陈裕坤 赖钟雄 王天池 林玉玲** 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 福州 350002 摘 要 为了解植物miR159家族成员的进化特性及其在不同组织部位的表达规律,以龙眼miR159家族为例对miRNA 家族进行探讨. 通过龙眼miR159家族前体与成熟体序列比对、前体二级结构预测、系统发育进化树的构建、靶基因 预测及实时荧光定量等手段,对龙眼miR159基因家族进行研究. 结果显示:龙眼 miR159家族存在7个前体成员和 6 个成熟体成员,序列比对发现 5个成熟体可以高度定位于7个前体序列中一个共有的、约 20个碱基的保守区域,推测 miR159成熟体主要来源于该区域;进一步分析发现6个成熟体序列中仅 2个可定位于pre-MIR159 中. mfold预测结果显 miR159 7 56.54 - 92.53 kal/mol 示 家族 个前体的最小折叠自由能在- - 之间,均能自发形成典型、稳定的茎环二级结构. 系 统发育进化树显示龙眼miR159家族前体与成熟体成员均具有保守性与多样性. 靶基因预测发现龙眼miR159家族所有 成员共预测出14个不同靶标,其中3个成员也可以作用于同一靶标. 实时荧光定量PCR显示,龙眼pre-MIR159家族成员 dlo-miR159 间在不同组织部位表达量差异显著,但表达趋势却几乎一致,其中花器官中表达量最高,提示了 在生殖器 官形成过程中具有重要的作用,尤其是在雄花中作用显著. 本研究表明龙眼miR159家族在进化过程中形成了保守性 与多样性并存的进化特性,并且可能在花器官形成过程中发挥了重要的作用. (图5 表3 参36) miR159 关键词 龙眼; 家族;进化特性;实时荧光定量 CLC S667.203 Evolutionary characteristics of miR159 gene family in Dimocarpus longan Lour., and their spatial and temporal expression* CHEN Xu, ZENG Youjing, WANG Jiayi, CHEN Xiaohui, XU Xiaoping, LI Hansheng, ZHANG Zihao, ** ** CHEN Yukun, LAI Zhongxiong, WANG Tianchi LIN Yuling Institute of

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