大鼠细胞因子信号转导抑制因子一1基因的多态性-中华危重病急救医学.pdfVIP

CritCare 2010 ·259· 中国危重病急救医学2010年5月第22卷第5期ChinMed，May1V01．22，No．5 ·论著· 大鼠细胞因子信号转导抑制因子一1基因的多态性 及其结构分析 徐嘉 马中富 唐皓 粱艳冰 陈志斌 李振宇 吴敬国 梁华平 胡旭初 【摘要】 目的 扩增大鼠细胞因子信号转导抑制因子一1(SOCS一1)基因，利用生物信息学方法预测其结 构和功能特征，为进一步的实验研究提供理论指导。方法扩增并测序大鼠的SOCS一1编码区序列，利用生物 NTIsuite软件包，识别大鼠SOCS一1基因并预测其编码蛋白质的各种 信息学网站的在线分析工具和Vector 结构特征，根据该基因构建其分子进化树。结果 聚合酶链反应(PCR)扩增获得2个序列不同的SOCS一1基 因，BLASTx分析该基因为全长基因，该基因全长639bp，编码212个氨基酸(aa)，具有1个SOCS盒 含有2个线性B细胞抗原表位，全部位于蛋白的表面，并在空间结构上相距较远。结论SOCS一1基因具有基 因多态性，其保守的SH2区域及SOCS盒与其对信号转导通路抑制作用有关，而其核定位序列可能影响其他 核转导因子，B细胞线性表位则在免疫诊断方面有较好的应用前景。 【关键词】细胞因子信号转导抑制因子一1； 基因多态性；生物信息学；大鼠 andstructuralof of ofratXUJia。．MA Polymorphism analysissuppressorcytokinesignaling一1 Zhong- Hao，LIANG ENZhi—bin，LI ANG 缸，TANG Yan-bing，cH Zhen—yu，WUJing-guo，LlHua—ping，HU GeneralInternalMedicine，theFirst SunYat—sen of Affiliatedof Xu—chu．。Department HDs／)ital University， 51 Guangzhou0080，Guangdong，吼ina author：MA 2f@to,n．covn CorrespondingZhong一丘，Email：?lid To the of ratfromthe [Abstract]Objectiveidentifysuppressorcytokinesignaling-1(SOCS-I)of 7 with to thededucedSstructureandfunctioninorder the ofbioinformaticspredict protein amplifiedgene help to thefoundationforfurthertheoretical The ratSOCS一1was lay study．Methodsfull—length gene amplified structurefunctionofits andidentifiedfromtheGeneBankNueleotidedatabase。andthe and corresponding deduced was theb