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多肽合成中的具体问题
探讨 Methacrylic acid 在多肽合成中出现的问题; Methacrylic acid;; 20168:(methylacryamide)-GGGGRGDS
这条序列在合成过程中并不困难,卢经理建议我在这条肽的切割过程中注意切割液的酸浓度不要太高,我猜想有可能是因为酸浓度过高会影响2-甲基丙烯酸的性质,从而影响多肽的合成效果。
所以在这条肽的切割过程中主要以改变切割液酸的浓度的方法来观察对序列产物效果的影响。;
1、TFA/苯甲硫醚/苯甲醚/EDT
90/5/3/2
2、TFA/苯甲硫醚/苯甲醚/EDT
85/8/4/3
3、TFA/苯甲硫醚/苯甲醚/EDT
80/10/6/4
保持切割时间相同,都为2.5h。;1、TFA/苯甲硫醚/苯甲醚/EDT 90/5/3/2 (粗品分析图);2、TFA/苯甲硫醚/苯甲醚/EDT 85/8/4/3 (粗品分析图);3、TFA/苯甲硫醚/苯甲醚/EDT 80/10/6/4 (粗品分析图);结论; 之前季海建做过一条C端侧链接2-甲基丙烯酸的多肽:19545 HSNGLPLGGGGK(methylacryamide)
考虑到这条肽与20168有些相似,所以拿这两条肽来比较一下。; 20168纯品分析 19545纯品分析; 从两条肽的纯品分析情况来看,在19545中将2-甲基丙烯酸接在侧链时得到的多肽产物比较杂,纯度也较差;而20168中将2-甲基丙烯酸接在主链上时得到的多肽产物纯品纯度较高。并且19545在合成过程中,难度也较大。
两条肽纯品分析结果差异较大可能是因为2-甲基丙烯酸的连接位置不同,也有可能是两条肽的主链有较大的差异(19545在接2-甲基丙烯酸前没有对直线进行分析,有可能是直线效果不好)...
; 对19545(HSNGLPLGGGGK(methylacryamide))进行分析,首先从主链看,序列最后接上的是组氨酸,由于组氨酸较于其他氨基酸稳定性较差,在合成过程中特别容易产生消旋。(查阅相关文献:多肽合成过程中,部分氨基酸在活化的过程中会导致不同程度的消旋,特别容易消旋的氨基酸有:Cys,His,Phe)由于消旋化对于多肽合成和纯化工艺具有很大的重要性,对于一个10肽,如果每个氨基酸仅发生1%的差向异构化,则合成终产物的光学纯度就只有90.4%,而对于一个50肽,其光学纯度则仅有60.5%。最后可能导致纯化的分析结果很差。
目前已经将19545重新合成,在合成过程中可以通过采???高效缩合试剂,减少反应时间,来减少消旋的比例。
; 还有在切割过程中,切割液里的EDT可能会对2-甲基丙烯酸产生影响,所以在切割重新合成的19545时要注意控制EDT的量,尽量减少对2-甲基丙烯酸的影响。; 最后猜想可能是将2-甲基丙烯酸接到侧链上时,有可能会降低序列产物的效果,而将2-甲基丙烯酸接到序列主链上时序列产物的效果会好很多。
; 由于造成多肽合成产物分析结果不同的其他因素还有很多(比如说在序列合成时反应条件以及切割条件....),要想确定2-甲基丙烯酸在多肽上的连接位置对多肽合成产物效果的影响,还要进行更多的实验。
;
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