临床基因诊断进展陈鸣.ppt

OUTLINE Introduction “Science”: Foder提出基因芯片概念 1991 第一张基因芯片：美国Affymetrix公司 1992 第一张以玻璃为载体的基因芯片： Stanford大学P．Brown实验室，1995 “Science”: Schena 基因表达谱的研究，1995 第一张实用型基因芯片：Affymetrix 1996 中国科学界第一次专项讨论：第80次“香山科学会议”上， 1997年9月 1998年度自然科学领域十大进展之一 美国正式启动基因芯片计划：1998 “生物芯片技术”正式列入国家“863”计划 ：1999 Luminex 200TM多功能流式点阵仪 液态芯片是基于Luminex200TM（美国Luminex公司）的是一个多功能生物芯片平台，既能检测蛋白、又能检测核酸的高通量技术平台 通常用于免疫分析、核酸分析、受体和配体分析等临床检测和科学研究 LuminexTM有机地整合了编码微球、激光技术、应用流体学、必威体育精装版的高速数字信号和计算机运用法则，具有很高的检测特异性和灵敏度 Luminex xMAP? Technology - 2 HPV DNA分型检测液芯操作配套设备 液芯HPV DNA分型产品三大优势 激光分析，数字结果 无需洗涤，减少污染 液相杂交，重复性好 液相杂交，效率高、重复性好 已获SFDA药证的项目 HPV分型（高危、低危型，同时检测26种压型） 肿瘤标志物（13种） 自身免疫性疾病的诊断标记物 OUTLINE 人类基因组计划The Human Genome Project 1985: 提出对整个人类基因组DNA测序 1990: 国际合作项目，历时13年 花费： $3 Billion 测序技术的飞跃 2003年，“HGP”获得首张人类全基因组图谱，花费了30亿美元和13年的时间 Craig Venter开发出一种快速追踪测序方法，并于2007年9月完成Venter自身全基因组的测定工作，花费了大约1亿美元 测序技术的飞跃 2008.4.17《Nature》杂志上， 454测序新技术：美国454 Life Sciences公司，花了150万美元，4个月 Illumina genome analyzer Applied Biosystems SOLiD sequencer 测序技术的飞跃 Helicos公司开发的HeliScope Sequencer “单分子测序” 不需要PCR扩增 成本最低 目标：10万美元，3个工作日左右 一个重要的里程碑 在联系个人化基因组和个人化治疗方面 破解生命密码并找到缺陷基因 对于各种遗传疾病、癌症、肥胖等具有难以估量的意义 测序技术在临床上的应用 肝炎病毒变异、分型的检测（HBV ） 预测某些疾病的遗传风险程度（乳腺癌、结肠癌） 个体化用药指导 （肿瘤化疗用药指导） 肝炎病毒变异、分型的检测（HBV ） 乳腺癌( breast cancer) 发生于乳腺导管上皮细胞的恶性肿瘤 是女性常见的肿瘤之一,约占全身恶性肿瘤的7 % - 10% 全世界每年新发乳腺癌约150 万例,死亡约57 万例 Genetics BRCA-1 BRCA-2 P53, Rb-1 Her-2/neu, c-erB2, c-myc BRCA1、BRCA2基因突变与乳腺癌 通过对有乳腺癌家族史妇女的BRCA1和BRCA2基因突变的检测显示,此类人群中约有10%为BRCA1和BRCA2基因突变的携带者。BRCA1和BRCA2基因突变的携带者到70岁时,发生乳腺癌的风险累计达到80%-85% ,一生中发生乳腺癌的风险可高达90% BRCA1和BRCA2基因突变的检测是对于有乳腺癌家族史人群进行乳腺癌筛查和早期诊断的有效方法 What can YOU do? 每个人是不同的… 大多数病人的治疗方案是相同的… 医药费: 数以万计的钱花在没有疗效的药物治疗 死亡/病重: 2.2 亿严重的病例和超过100万的死亡例数 相同药物，相同药效？ SNP SNP: 单核苷酸多态性 （Single Nucleotide Polymorphisms） 国际成熟的肿瘤靶向用药的分子检测 分子信号通路 国际成熟的肿瘤用药毒作用预测性分子检测 大坪医院检验科 肿瘤分子分型检测的四大方面 伊立替康：因UGT1A1 TATA盒中TA重复数6TA/7TA的不同毒性差别显著；有必要调整剂量 国际研究中的肿瘤用药敏感性和毒性预测性分子检测 氟尿嘧啶类；铂类；紫杉醇类，蒽环类 固态芯片产品：膜条式反向杂交，基质不均一，温控困难，重复性差 液芯产品：液相杂交，反应彻底，温控严格，重复性好 测序技术 乙肝病毒耐药突变检测 预测某些疾病的遗传风险程度 肿