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浙江农业学报ActaAgriculturaeZhejiangensis,2013,25(6):1220—1224 http://www.zjnyxb.en
路伏增,褚晓红,戴丽荷,等.MUC13基因参与的仔猪腹泻 控网络图谱构建 [J].浙江农业学报,2013,25(6):1220—
1224.
DOI:10.3969/j.issn.1004—1524.2013.06.09
MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络图谱构建
路伏增 ,褚晓红 ,戴丽荷 ,陈绍孟 ,傅春泉 ,胡锦平 ,徐如海
(‘浙江省农业科学院 畜牧兽医研究所,浙江 杭州 310021;金华职 技术学院,浙江 金华 321000)
摘 要:为进一步阐述仔猪腹泻发生的分子机制,应用生物信息学方法构建了MUC13基因参与的仔猪腹泻
调控网络 冈谱 ,并对其中的基凶进行基 冈功能聚类分析。首先,选择物种为猪,通过 STRING数据库分析发
现与MUC13相关联的有 l0种蛋 白(MUCA,MUC20,LRCH3,FLJ33471,ACK,ZDHHC19,CTPCT,APOD.Msp.
CD71);其次,根据筛选到的蛋白,构建了仔猪腹泻调控网络,并从中找到了MUC13基因参与的仔猪腹泻调控
网络,该网络包括MUCI3,MUC4,MUC1,MUC2,MUC3, 乃 ,NOD1,TNFSFIO,FGFR1,CDH2等 10个基 ;最
后,采川DAVID数据库对图谱中的这 10个基因进行基 功能注释分析,发现富集相关程度较高的一些基因
聚类条 目有上皮生长凶子 (EGF)序列、SEA模块、跨膜结构域 、胞质尾区等,因此推测MUC13基因结构的特
异性决定了其在仔猪腹泻发展过程中具有特定的功能。文章建立的MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络
具有一定的真实性 ,可以用来描述仔猪腹泻症发生发展过程中分子的相互作用。
关键词:MUC13;仔猪腹泻;调控网络
中图分类号:S858.28 文献标志码 :A 文章编号:1004—1524(2013)06—1220-05
ConstructionofpigletdiarrhearegulationnetworkinvolvedwithM UC13gene
LU Fu—zeng’ CHU Xiao—hong ,DAILi—he’
, , CHEN Shao—meng ,FU Chun—quan ,HU Jin—ping ,XYU Ru—hai1
(I‘nstitute AnimalHusbandrySciencesandVeterinaryMedicine,ZhejiangAcademyofAgriculturalSciences,Hang—
zhou31002i,ChinazjinhaavocationatandTechnicatCollege,Jinghua310000.China、
Abstract:ThisstudydevelopedaregulationnetworkofpigletsdiarrheainwhichMUCI3geneparticipatedandmade
anassayofgenefunctionalannotation clustering.Firstly,10 MUC13一associated proteinsweregeneratedthrough
Sf1RING9.0(MUC4,MUC20,LRCH3,FLJ33471,ACK,ZDHHC19,CTPCT,APOD,Msp,CD71).Secondly,
usingthe10MUC13一associatedproteins,wedevelopedaregulationnetworkofpigletsdiarrheainwhichMUCI3gene
participated,whichincludedMUC13,MUC4,MUC1,MUC2,MUC3,TFF3,NOD1,TNFSFIO,FGb~I CDH2
genes.Finally,withDAVID bioinfonna
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