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动物育种数据管理与软件应用
第二十章 动物育种数据管理育种数据种畜基本档案、性能测定数据、遗传评估结果等可靠的数据是育种工作取得成效的基本保证影响性状表现的各种可以辨别的系统环境因素(如年度、季节、场所、操作人员等),以便于遗传统计分析。传统的育种管理方法由于其数据信息处理效率不高,导致育种操作难度大,效率低下,逐渐成为制约种生产的瓶颈利用现代信息处理工具,计算机辅助育种则适应现代育种发展要求,极大地提高育种效率,对育种和生产提供有效帮助。数据库设计要考虑数据结构的合理性、完整性和安全性,便于程序设计及系统的维护和升级。实行全国统一的种猪编号系统,编号系统由15位字母和数字构成编号原则为:前2位用英文字母表示品种:DD表示杜洛克,LL表示长白,YY表示大白,HH表示汉普夏,二元杂交母猪用父系+母系的第一个字母表示,例如长大杂母猪用LY表示;第3位至第6位用英文字母表示场号(由农业部统一认定);第7位用数字或英文字母表示分场号(先用1至9,然后用A至Z,无分场的种猪场用1);第8位至第9位用数字表示个体出生时的年度;第10位至第13位用数字表示场内窝序号;第14位至第15位用数字表示窝内个体号;建议个体编号用耳标+刺标或耳缺作双重标记,耳标编号为个体号第3位至第6位字母,即场号,加个体号的最后6位。例如,DDXXXX209000101表示XXXX场第2分场1999年第一窝出生的第一头杜洛克纯种猪。表201 个体记录
个体号 品种 性别* 出生日期 父亲号 母亲号 备注 名称 ID BREED SEX BDATE SIRE DAM NOTE 类型 字符 字符 字符 日期 字符 字符 备注 长度 15 2 1 8 15 15 — 小数位 — — — — — — — * 公猪用M、母猪用F表示。表202 生长性能测定记录
个体号 达50kg 达100kg 30~100kg饲料转化率 备注 称重日期 体重 测定日期 体重 膘厚 眼肌厚度/面积 仪器* 名称 ID DATE50 WT50 DATE100 WT100 FAT LMA EQ FCR NOTE 类型 字符 日期 数字 日期 数字 数字 数字 字符 数字 备注 长度 15 8 5 8 6 5 5 1 4 — 小数位 — — 2 — 2 2 2 — 2 — * A表示A超系列、B表示B超系列。表203 屠宰测定记录
个体号 屠宰日期 宰前重 胴体组成性状 肉质性状 备注 胴体重 后腿比例 膘厚* 眼肌面积 pH值 肉色 滴水损失 大理石纹 名称 ID SDATE SWT CWT HAM CFAT CLMA PH COLOR DRIP MARBL NOTE 类型 字符 日期 数字 数字 数字 数字 数字 数字 数字 数字 数字 备注 长度 15 8 5 5 5 5 5 4 3 5 3 — 小数位 — — 2 2 2 2 2 2 1 2 1 — * 膘厚为三点平均膘厚,按国标执行。表204 母猪繁殖性能记录
个体号 配种日期* 公猪号* 配种方式** 胎次 产仔记录 寄养情况 21日龄 备注 日期 总仔数 活仔数 死胎 畸形 木乃伊 寄出 寄入 头数 窝重 名称 ID MDATE BOAR TYPE PARITY FDATE TNB NBA SBN ABN MUM OUT IN LN21 LWT21 NOTE 类型 字符 日期 字符 字符 数字 日期 数字 数字 数字 数字 数字 数字 数字 数字 数字 备注 长度 15 8 16 1 2 8 2 2 2 2 2 2 2 2 5 — 小数位 — — — — — — — — — — — — — — 2 — * 以最终配上的日期和公猪为准;** A为人工授精,N为自然交配,B为同一情期同时使用人工授精和自然交配。
根据遗传评估的需要,建立统一的育种数据库,通过计算机网络,如Internet,实现信息共享,定期将各场数据进行分析处理,采用动物模型BLUP法估计个体育种值,评定个体的种用价值和各场的生产管理水平,将评定结果通过计算机网络传送到各场(Misztal和Lawlor,1999)
每一轮评估完成后,将评估总结通过电子邮件有选择地发送给一些用户。评估总结可以包括通过评估变化显著的一些最优秀个体以及经授权可以登录数据库的用户。当收到质询请求后,质询系统首先核实质询者的登录权限,然后对质询内容进行处理,最后将处理输出结果通过交互方式或文件传输反馈给质询者。
四、常见的数据误差
育种中,数据的正确与否直接关系到育种工作的成败,因此,获得准确而有效的数据对育种工作是至关重要的。常见的数据误差主要有两种
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