柑橘CjGH3.4和CjGH3.7基因的生物信息学分析及表达分析.pdf

园艺学报，2015 ，42 (12) ：2362 –2372. Acta Horticulturae Sinica 2362 doi ：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0589；http ：//www. ahs. ac. cn 柑橘CjGH3.4 和CjGH3.7 基因的生物信息学分 析及表达分析 1,2 2 2 1 2 2 2 庞少萍 ，谢让金 ，马岩岩 ，钱 春 ，何绍兰 ，易时来 ，吕 强 ， 郑永强2 ，邓 烈2,* 1 2 （西南大学园艺园林学院，重庆 400715 ； 西南大学/ 中国农业科学院柑桔研究所，重庆 400712 ） 摘 要：以资阳香橙（Citrus junos Sieb. ex Tanaka ）为材料，基于柑橘全基因组对两个生长素酰胺合 成酶基因 GH3 （Gretchen Hagen 3 ），即 CjGH3.4 和 CjGH3.7 进行生物信息学分析及表达分析。结果表明： CjGH3.4 的开放阅读框（ORF ）长度为 1 830 bp，编码 609 个氨基酸；CjGH3.7 的 ORF 为 1 800 bp，编码 599 个氨基酸。基因结构分析显示 CjGH3.4 含有两个内含子，CjGH3.7 含有 3 个内含子。通过比对发现， 这两个基因编码的蛋白序列与拟南芥、水稻、大豆、杨树等具有的较高的同源性，相似度可达 66% ~ 81% 。 CjGH3.7 主要在叶组织中表达，CjGH3.4 在根和叶组织中表达均较高，且叶高于根。在根和叶组织中， CjGH3.4 和 CjGH3.7 均受低温、高盐以及 PEG 胁迫诱导，表明其参与了柑橘逆境响应过程。CjGH3.4 和 CjGH3.7 在叶中受到 ABA 、ACC 、MeJA 和 SA 等诱导，在根中却受到抑制，呈现相反的表达模式。 关键词：柑橘；植物激素；逆境；GH3；基因表达 中图分类号：S 666 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2015 ）12-2362-11 Bioinformatics and Expression Analysis of CjGH3.4 and CjGH3.7 Genes in Citrus 1,2 2 2 1 2 2 2 PANG Shao-ping ，XIE Rang-jin ，MA Yan-yan ，QIAN Chun ，HE Shao-lan ，YI Shi-lai ，LÜ Qiang ， ZHENG Yong-qiang2 ，and DENG Lie2,* 1 2 （College of Horticulture and Landscape Architecture，Southwest University ，Chongqing 400715 ，China；Citrus Research Institute ，Southwest University –Chinese Academy of Agricultural Sciences，Chongqing 400712 ，China） Abstract ：Based on genom