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湖南省草莓灰霉病菌遗传多样性研究
2016(7):37-43 中 国 蔬 菜 研究论文
CHINA VEGETABLES
湖南省草莓灰霉病菌遗传多样性研究
1,2 3 1* 1,2,4* 1 1
刘双清 王 翀 张 亚 廖晓兰 马文月 柏连阳
(湖南农业大学植物保护学院,湖南长沙410128; 植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室,湖南长1 2
沙410128;3 湖南农业大学理学院,湖南长沙410128; 湖南省生物农药与农药制剂加工工程技术研究中4
心,湖南长沙410128)
摘 要 :为探明湖南省草莓灰霉病菌群体遗传结构、分化及变异规律,采用荧光标记技术对湖南省9个地理菌群的180株草
莓灰霉病菌基因组DNA进行SSR分析。结果表明:9对SSR引物共检测到56个观察等位基因(Na),平均值为6.22;有效
等位基因(Ne)为1.27~4.89,平均值为3.44;不同位点的基因多样性指数(H)为0.21~0.80,平均值为0.65;不同位点
Shannon’s信息指数(I)为0.37~1.83,平均值为1.34。供试180株样品9个SSR多态性位点上多态性信息量PIC变化范围
为0.13~0.91,不同位点PIC差异大,这一规律与I和H基本一致。不同SSR位点总的遗传多样性(Ht)为0.21~0.77,平
均值为0.65;群内遗传多样性(Hs)为0.19~0.50,平均值为0.40;遗传分化系数(Gst)为0.10~0.46,平均值为0.37;基
因流(Nm)为0.58~4.47,平均值为1.16。不同地理菌群平均观察等位基因(Na)、有效等位基因数目(Ne)分别为2.93和
2.07,Shannon’s信息指数(I)平均为0.67,基因多样性指数(H)平均为0.40,平均多态性位点数(NP)、多态位点百分率
(P)分别为6.78和75%。依据不同地理菌群之间的遗传距离(0.2797~1.9225),将供试湖南省9个地理菌群分为4大类:
第Ⅰ大类主要由长沙、邵阳、岳阳、衡阳、张家界、湘潭种群组成;第Ⅱ大类主要由郴州种群组成;第Ⅲ大类主要由株洲种
群组成;第Ⅳ大类由常德种群组成。总之,湖南省各地草莓灰霉病菌群体遗传多样性丰富,但地理群体间差异小,病菌遗传
变异主要来自群体内部,不同地区间存在病菌的移动。
关键词 :湖南省;草莓灰霉病菌;遗传多样性;SSR标记
草莓灰霉病是草莓的重要病害之一,是由灰 种、管理等因素的关系,成为明确草莓灰霉病菌起
葡萄孢菌(Botrytis cinerea )引起的真菌性病害, 源、演化规律、传播规律以及制定防控方案的关键
该病菌既有致病性也有腐生性,寄主范围广泛,可 问题。近年来,国内外许多研究开始关注草莓灰霉
为害黄瓜、番茄、辣椒等200多种寄主植物,每年 病菌的多样性研究。Ma和Michailides(2005)利
造成的损失可达10%~30%,严重的甚至达到89% 用MP-PCR技术研究了美国佛罗里达州不同寄主
(Ugolinietal.,2014)。草莓灰霉病菌不仅适应性 上灰霉病菌菌群遗传结构,认为不同寄主上灰霉病
强、繁殖速度快、菌源量大,而且易受外界环境条 菌分化程度高,一些菌群不能聚集一起,而且菌群
件的影响发生变异,往往难以控制(Rosslenbroich 重组方法不一致。余文贵等(2011)研究了江苏省
Stuebler,2000)。因此,研究草莓灰霉病菌遗传 草莓灰霉病菌的多样性,认为采用SSR技术聚类的
结构、遗传分化、遗传变异以及与地理、气候、品 结果与采集样本具有高度的一致性,但是其研究不
系统,仍有很多指标未研究。Isenegger等(2008)
刘双清,男,讲师,主要从事植物病害综合治理方面的研究,E-mail:
liushuangqing104@163.com 利用不同的转座子类型对南亚和澳大利亚地区灰霉
*通讯作者(Correspondingauthors):张亚,男,副教授,主要从事
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