蛋白质-氨基酸、肽、蛋白分子结构.ppt

有显著紫外吸收的氨基酸： Tyr 275nm Phe 257nm Trp 280nm 八、氨基酸的重要化学反应 ◆茚三酮反应： -水合茚三酮试剂 ◆桑格(Sanger)反应： -DNFB (2，4-二硝基氟苯) ◆艾德曼(Edman)反应： PITC (苯异硫氰酸) ◆蛋白质是以氨基酸为基本单位的生物大分子。 ◆许多个氨基酸由酰胺键连接在一起，形成不分支的多聚物,称为多肽链。 肽键： 一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的 ?-氨基脱去一分子水缩合后形成的酰胺键，也称为肽键（peptide bond.） 蛋白质结构层次的推测 多肽链折叠的空间限制 a-C 原子为肽平面间的连接点 ↗ ↗ ↗ ↗ ↗ 二面角 多肽链折叠的空间限制 F: Ca -N Y: Ca - C F=0 y=0 ° ° → ← R a-C a-C a-C 二面角 F=180 y=180 ° ° 多肽链折叠的空间限制 180°= =0° ?角 ◆自身所感知的生命现象或  功能； ◆在已有理论基础上的推测； ◆借助相关仪器和试验所得出 的结果； 综上，得出结论。 第四节 蛋白质的分子结构 一、基本认识 二、入手点 三、蛋白质的  结构层次…….. ★ ★ 一、基本认识 ★ 1.构型与构象 构型的改变必须断裂共价键; 构象的改变仅是 C-C 单键自由旋转的结果。 肽键（酰胺键） 蛋白质高级结构的构建属于构象范畴! 超分子集合体 ★ 基本认识： 2.蛋白质分子是氨基酸的多聚物，每一种蛋白质均有其唯一而确定的氨基酸顺序。 3. 蛋白质分子的折叠  过程应该是自发的，并且应该是一个高度定向和协同的过程。 4.蛋白质折叠所形成的天然的且高度有组织的构象应该是蛋白质自身分子之间以及与周围溶剂分子之间各种相互作用精确平衡的必然结果。 5、每一种蛋白质的空间构象应该是唯一而确定的，应该是一种能量最低状态。 5.蛋白质的生理功能是由其高级结构（空间构象）完成的。 结构 → 功能 ←--- ? 一、基本认识 ★ 二、入手点 ？ 第四节 蛋白质的分子结构 ★ 入手点： 1.蛋白质是大分子多聚物！ 2.结构物质的基本特性？ 3.生理环境因素的影响—水？！ 4.各种作用力的相互平衡？ 5.多肽链中可能存在的有组织的  局部排列？ 一、基本认识  二、入手点 第四节 蛋白质的分子结构 三、蛋白质空间构象的形成与蛋白质的结构层次 （一） 构建过程中需要考虑的相关 因素： 1. 折叠过程是高度定向和  协同的过程，主要是两方  面因素的平衡： ②.能量因素： 非共价键的 键合. ①.几何因素： 空间位阻和 立体效应 2. 水的化学特性是决定  蛋白质构象的重要因素 极性分子 AA的R基团？ （亲水性） （疏水性） 氢键体系 ↘ ↗ 3. 决定蛋白质构象的  主要作用力： ◆氢键、 ◆静电作用力、 ◆疏水作用力（逃避水相环境  的趋势，疏水内核的形成）、 ◆分子间作用力（范德华力，  范德华半径）。 （二）蛋白质的结构层次 为了研究和讨论的方便，人为划分为： 一级结构、二级结构、超二级结构、结构域、三级结构、四级结构。 ★ 蛋白质的一级结构： 由酰胺键连接而成的蛋白质多肽链中氨基酸的种类、数量和排列顺序。 共价键连接，共价主链 蛋白质多肽链的结构特点： 多肽链由一个规则的无分支的单调重复的主链和变化多端的侧链两部分构成。 主链 → R 基团 ↘ 肽键 天然构象的折叠信息贮存于氨基酸的排列顺序之中！ 即：蛋白质的一级结构决定其折叠特性 H2O H2O H2O H2O （二）蛋白质的结构层次 蛋白质的一级结构 决定其折叠特性 肽键 （酰胺键） 2. 构象的空间限制： ‥ 孤对电子 离域 ＋ － d- d+ 共振杂化体 肽平面的形成 肽平面 a-C 原子为肽平面间的连接点 ↗ ↗ ↗ ↗ ↗ ①.肽平面/酰胺平面  的刚性 ②. 侧链基团的空间  位阻 2. 构象的空间限制： * * * 氨基酸 蛋白质的 构件单元 第一节 蛋白质的元素组成  第二节 蛋白质的构件单元  —— 氨基酸  第三节 肽 第四