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转座子类型
转座子
1、转座子的基本概念
2、转座子的转座特征
3、转座子的类型
4、转座子的转座机制
5、转座引起的遗传效应
1、转座子的基本概念
转座子(transposon,简称Tn), 又称易位子,是指存在于染色体DNA上可以自主复制和位移的一段DNA序列。
BACK
2、转座子的转座特征
(1) 基因组内移动;
(2) 不依赖于供体与受体间的序列关系;
(3) 一般仅移动转座子序列本身。
BACK
3、转座子的类型
3.1 简单转座子(插入序列)Simple transposon ( insertion sequence)
结构特征和转座特点
3.2 复合转座子 (Composite transposon)
结构特征和转座特点
3.3 类插入序列 (IS-like elements)
3.4 TnA家族
BACK
插入序列的结构特征
(1)含短的末端反向重复序列,且每条链上的反向重复序列可以相互配对形成茎环结构;
(2)含编码转座酶的基因(其突变将导致不能转座);
(3)在转座子两外侧的靶DNA中存在 5-9 bp 的短正向重复序列。
正向重复序列的形成过程
转座酶
DNA聚合酶和连接酶
插入序列的转座特点
作为一个整体进行转座。
复合转座子
由两个重复序列夹着一个或多个结构基因如某些抗药性基因和其它基因组成,其两端的组件由IS和类IS组成。
转座因子
长度(bp)
遗传标记
末端组件
方向
二组件的关系
组件的功能
Tn903
3100
KanR
IS903
反向
相同
二者皆有功能
Tn9
2500
CamR
IS 1
正向
推测相同
预计有功能
Tn10
9300
TetR
IS 10R
有功能
IS 10L
反向
有2.5%的差异
无功能
Tn5
5700
KanR
IS 50R
有功能
IS 50L
反向
1 bp的改变
无功能
复合转座子的结构特征
(1)中间区域含编码转座酶以外的标记基因;
(2)两端具有插入序列;
(3)两末端是反向重复序列;
(4)靶位点存在短正向重复序列。
复合转座子的转座特点
可以作为一个整体进行转座;
含有的一个或两个IS元件也可进行单独转座。
类插入序列
指IS10R,IR50R和IS903,它们的结构和IS相似,但不独立存在。而是作为复合转座子(compositetransposons)两臂的组件。
TnA家族
长约5kb左右,两端具有IR,而不是IS,中部的编码区不仅编码抗性标记,还编码转座酶和解离酶的DNA序列。
4、转座子的转座机制
所有转座子的共同机制:
在靶DNA上造成交错切口,转座子与突出的末端相连,填补缺口。
据转座子的移动机制,可分为:
◆复制型转座(replicative transposition)
◆非复制型转座(nonreplicative transposition)
◆保守型转座(conservative transposition)
BACK
转座子
靶质粒
第一步
切口DNA
第二步
连接自由末端
第三步
转座子复制
第四步
完成复制
=
第五步
Res位点两侧重组
第六步
Tn3的复制式转座
Nonreplicative transposition
Conservative transposition
供体保持裂缺。不形成共合体。
5、转座引起的遗传效应
(1)引起插入突变
(2)产生新的基因
(3)引起生物进化
(4)引起染色体畸变
注:转座引起DNA重排(Rearrangement)
转座子多个拷贝之间的同源重组引起宿主DNA的重排;
转座子重复序列间的同源重组导致精确或不精确切除。
真核生物的转座子
物种
II类转座因子家族
ITR
TSD
果蝇
P
Hobo
Mariner
FB
31
12
28
大
8
8
2
9
线虫
Tc1
54
2
玉米
Ac/Ds
Spm/dsom
Mu/mn
10/11
13
200
8
3
9
金鱼草
Tam1
Tam3
13/14
12
3
8/5
一些真核生物
TU/puppy
大
8
反转录病毒的反转录转座子
含有LTR的反转录转座子
非LTR的反转录转座子
Thank you!!!
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