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琼脂糖凝胶电泳检测
仪器 1. 水平式凝胶电泳槽 2. 稳压电泳仪 3. 电炉 4. 紫外检测仪 5. 台式离心机 琼脂糖凝胶制备步骤 1. 洗净电泳槽、制胶槽、梳子、挡板,晾 干; 2. 插好挡板、梳子; 3. 配制1 %的 Agrose琼脂糖凝胶液:根据实验所需称取0.4克琼脂糖,放入制胶 的容器中(一般用三角瓶),然后加入40ml电泳缓冲液(1×TAE); 4. 加热煮沸,使琼脂糖完全溶解; 5. 待Agrose琼脂糖凝胶液稍凉(约55℃左右,不烫手)后,加入 约1/1000的1 mg/ml溴化乙锭溶液(约3.5 μL至终浓度为0.5-1 μg/ml)后轻轻混匀,倒入制胶槽上,勿起气泡(避免剧烈摇晃产生气泡); 6. 室温下约30分钟后,琼脂糖溶液完全凝固,小心垂直拔出梳子和挡板,清除碎胶,将凝胶放入电泳槽中; 7. 加入电泳缓冲液(1×TAE)至电泳槽中,使液面高于胶面约1mm; 8. 在DNA样品中加入2μL (1/10体积)的10× DNA上样缓冲液(loading buffer),混匀,稍甩一下,使溶液都处于离心管底; 用移液器吸起离心管中溶液,移入凝胶的梳孔中; 插上导线,打开电泳仪电源,按照需要调节电压至100V,电泳开始,观察电流情况或电泳槽中负极的铂金丝是否有气泡出现; 等溴酚蓝泳动至凝胶前沿后,将电压(或电流)回零,关闭电源,停止电泳; 取出凝胶,在紫外观测仪上观察电泳结果; 根据需要切下DNA条带,放入1.5ml Ep管中,放于4℃保存,以备下周实验用。 实验结果及讨论 质粒DNA在琼脂糖凝胶中一般为三条带,最前面的条带为超螺旋构型,中间为线型,最后为单链有缺刻的构型。 本实验PCR产物大小约在1100-1200bp之间 * * 琼脂糖凝胶电泳检测 了解琼脂糖凝胶电泳的原理 掌握琼脂糖凝胶的制作及进行电泳的方法 琼脂糖凝胶电泳是基因工程操作中常规的实验方法,它能检测少量的DNA(如用肉眼观察,可检测到10 ng的DNA),且检测的范围很广。 琼脂糖凝胶电泳对DNA分子的检测,主要基于在凝胶中加入溴化乙锭,这样溴化乙锭分子就会嵌入DNA分子中形成络合物,使DNA在紫外光下发射很强的荧光,而在紫外光下DNA发出的荧光是可见光。 在溴化乙锭足够的情况下,荧光的强度正比于DNA的含量,因而DNA的检测很方便。如将已知大小和浓度的标准样品(Marker)作电泳对照,就可估计出待测样品的大小和浓度。 50×TAE电泳缓冲液(pH8.0): Tris 242g 冰醋酸 57.1ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 100ml 稀释到电泳缓冲液1×TAE 溴化乙锭溶液 :10mg/ml水溶液,室温,棕色瓶或铝铂纸包装保存。 4. 10×(6×) ×DNA样品上样缓冲液 (Loading Buffer,溴酚蓝指示剂, DNA样品加样缓冲液) 琼脂糖Agarose pMD18-T Vector ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 使用3 mg的DNA Marker DL 2,000(500 ng/条带)进行1%的琼脂糖凝胶电泳后,各DNA条带自上至下分别为2kb,1Kb,750bp,500bp,250bp,100bp。
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