linux 安装 lammps.doc

方法一： 【原创】Linux下安装单机多核并行lammps（附meam包）(2010-12-08 08:45:50)转载▼标签： lammps并行安装meam 分类： 计算材料 总结：Linux下安装单机并行lammps ○．机器配置： 1．处理器：Intel XEON × 2 2．主板：Intel S5500BC 3．内存：金士顿4G × 6 4．操作系统：Redhat Enterprise 5.3 x86_64 一．下载需要的源文件 fftw-2.1.5.tar.gz 下载地址：/download.html mpich2-1.0.2p1.tar.gz 下载地址：/pub/mpi/old/ lammps-1Dec10.tar.gz 下载地址：/tars/ 并以root身份（以下均在root下）拷贝到 /usr/local/src目录下 二．安装FFTW # tar xvzf fftw-2.1.5.tar.gz # cd fftw-2.1.5 # ./configure --prefix=/opt/mathlib/fftw215-gnu --enable-float # make # make install 三．安装MPICH2 # tar xvzf mpich2-1.0.2p1.tar.gz # cd mpich2-1.0.2p1 # ./configure --prefix= /opt/mpich2-gnu # make # make install 如果不出错，应该就是安装成功了。接下来的工作时进行配置。 MPI应用一个管理器来管理运行MPI程序，这个管理器就是mpd，但是在正式开始运行mpd前还需要一个基于安全考虑的配置文件.mpd.conf，这个文件是要放在运行程序的用户的home目录下，本例子中就是/home/mpi/.mpd.conf，而且这个文件只能由这个用户读写，创建文件的命令是， # cd $HOME # touch .mpd.conf # chmod 600 .mpd.conf 什么意思，我暂时也不太清楚，但是就这么做就可以了。 可参考：/s/blog_5f3365780100ojki.html 四．安装lammps，附带meam包 # tar xvzf lammps-1Dec10.tar.gz # cd lammps-1Dec10/cd lib/meam/ # make -f Makefile.gfortran (intall meam, you can also choose other versions) # cd ../src/MAKE # vim Makefile.g++ (edit the Makefile) ***********************************Makefile.g++ beginn********************************** （说明：红色字表示改动或添加的部分） # g++ = RedHat Linux box, g++4, gfortran, MPICH2, FFTW SHELL = /bin/sh # --------------------------------------------------------------------- # compiler/linker settings # specify flags and libraries needed for your compiler CC = g++ CCFLAGS = -g -O -DFFT_FFTW -DLAMMPS_GZIP -DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK \ -I/opt/mathlib/fftw215-gnu/include \ -I/opt/mpich2-gnu/include \ -I../../lib/meam DEPFLAGS = -M LINK = g++ LINKFLAGS = -g -O -L/opt/mathlib/fftw215-gnu/lib \ -L/opt/mpich2-gnu/lib \ -L../../lib/meam LIB = ARCHIVE = ar ARFLAGS = -rc SIZE = size # ------------------------------