BLAST 序列比对方法.doc

进入ncbi网站/ 进入BLAST比对 下拉页面进入 上面的对话框里输入标准序列 下面的对话框输入测序序列： Oligo软件：Edit——Enter sequence，如此即可复制序列 点击 即可出现结果： 如果发现有碱基突变： 3. 打开Primer Premier 5.exe File——new——DNA sequence 将标准序列以及测序序列输入编辑框 标准序列就用As is （正向序列） 点击 Standard——OK 即可生成氨基酸序列。 测序样品在输入时，由于测序结果是反向序列，要选择reverse complemented 将以上两段序列粘贴至一个txt文本中，自命名，放置在clustalx1.83文件夹下面 4.打开clustalx1.83软件 ——File——load sequence 选择刚刚保存的txt氨基酸序列文件 经过比对，没有氨基酸的突变，即可进行下一步实验 注意： 在blast比对时，返回上一级页面需要点击blastn suite-2sequences 在比对时如果出现碱基缺失如下 由于碱基缺失会导致移码，则次测序结果不可使用。