基于Vegan 软件包的生态学数据的排序分析(赖江山 米湘成)基于Vegan 软件包的生态学数据的排序分析(赖江山 米湘成).pdf

基于Vegan 软件包的生态学数据的排序分析(赖江山 米湘成)基于Vegan 软件包的生态学数据的排序分析(赖江山 米湘成).pdf

  1. 1、本文档共17页,可阅读全部内容。
  2. 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
  3. 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  4. 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
基于Vegan 软件包的生态学数据的排序分析(赖江山 米湘成)基于Vegan 软件包的生态学数据的排序分析(赖江山 米湘成)

中国生物多样性保护与研究进展Ⅸ— 第九届全国生物多样性保护与持续利用研讨会论文集 基于Vegan 软件包的生态学数据排序分析 赖江山 米湘成 (中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室,北京100093) 摘要:群落学数据一般是多维数据,例如物种属性或环境因子的属性。多元统计分析是 群落生态学常用的分析方法,排序(ordination)是多元统计最常用的方法之一。CANOCO 是广泛使用的排序软件,但缺点是商业软件价格不菲,版本更新速度也很慢。近年来,R 语言以其灵活、开放、易于掌握、免费等诸多优点,在生态学和生物多样性研究领域迅速 赢得广大研究人员的青睐。R语言中的外在软件包“Vegan”是专门用于群落生态学分析的 工具。Vegan能够提供所有基本的排序方法,同时具有生成精美排序图的功能,版本更新 很快。我们认为Vegan包完全可以取代CANOCO,成为今后排序分析的首选统计工具。本文 首先简述排序的原理和类型,然后介绍Vegan的基本信息和下载安装过程,最后以古田山 24公顷样地内随机抽取40个20m ×20m的样方为例,展示Vegan包内各种常用排序方法 (PCA,RDA,CA和CCA)和排序图生成过程,希望能为R的初学者尽快熟悉并利用Vegan包进 行排序分析提供参考。 关键词:R语言,软件包,群落分析,多元统计, PCA, RDA, CA,CCA Ordination Analysis of Ecological Data Using Vegan Package in R Jiangshan Lai, Xiangcheng Mi State Key Laboratory of Vegetation and Environmental Change, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093 Abstract: The multidimensional data on community composition, properties of individual populations, or properties of environment are fundamental materials for vegetation science. They need to be analyzed with taking their multidimensionality into account. Multivariate statistical methods are the perfect approaches for statistical analysis of such data sets. Ordination is fundamental in multivariate statistical methods. The CANOCO is popular program for ordination analysis, however, it is commercial software with high price. R language becomes one of the most popular statistical software in the world, because of open source and free. The Vegan package in R is the statistical analysis tools for community data. It has most basic functions of ordination analysis. Most of its multivariate tools can be used for other data types as well. The 中国生物多样性保护与研究进展Ⅸ— 第九届全国生物多样性保护与持续利用研讨会论文集 paper firstly briefly describes the basic information of Vegan pac

文档评论(0)

vshoulrengb3 + 关注
实名认证
内容提供者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档