太湖沉积物中的可培养细菌：I.细菌多样性初步分析太湖沉积物中的可培养细菌：I.细菌多样性初步分析.pdf

LakeSci．(湖泊科学)，2009，2l(1)：27-35 http：／／www．jlakes．org．E—mail：jlakes@niglas．ac．cn ~2009byJournalofLakeSciences 太湖沉积物中的可培养细菌：I．细菌多样性初步分析 周丽华 ，陈士超 3邓志瑞 ，陈 沁 ，郑乐平 ，刘志学 ” (1：上海大学环境与化学_丁程学院，上海 200444) (2：上海大学生命科学学院，上海200444) (3：同济大学生命科学与技术学院，上海200092) 摘 要：采用牛肉膏培养基培养，从不同深度的太湖沉积物中共分离得到603个菌落形态不同的菌株，通过数值分析比较了40个形 态表征性状，以不加权平均连锁聚类(UPGMA)的方式进行簇群归类，在O．75水平上可分成4个聚类群和51个亚群．从51个亚群中 各随机选取一个菌株，测定其 16SrDNA 部分序列(约 540bp)并据此进行分析，表 明这些菌株分别属于 Firmicutes、 Actinobacteria、y-Proteobacteria这三大类群，与数据库中已知的芽孢杆菌属(Bacillus)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、微球菌 属(Micrococcus)、节杆菌属(rthrobacter)、迪茨菌属(Dietzia)和假单胞菌属(Pseudomonus)细菌具有很高的相似性．其中迪茨菌 属在国内淡水湖泊沉积物中为首次报道． 关键词：太湖；沉积物；可培养细菌；数值分类；多样性 CulturablebacteriainthesedimentofLakeTaihu (I)：primaryanalysisofbacteria diversity ZHOULihua，CHENShichao，DENGZhirui，CHENQin，ZHENGLeping＆LIUZhixue (1：SchoolofEnvironmentalandChemicalEngineering，ShanghaiUniversity，Shanghai200444，PR．China) (2：SchoolofL Science，ShanghaiUniversiyt，Shanghai200444，P．RChina) (3：SchoolofLrieScienceandTechnology，Tong／iUniversity，Shanghai200092，PRChina) Abstract：Thesedimentsamplescollectedfrom thedifierentsitesoftheLakeTaihu，2006wereculturedontraditionalnutrient medium．603bacteriastrainswereseparatedwith40differentmorphologicalfeatures，andweregroupedinto4clustersand51 subclustersatthelevelof0．75withnumericalclassifiedbasedontheunweightedpairgroupmethodwitharithmeticaverages (UPGMA)algorithm．Basedonthepartialsequencesof16SrDNA(540bp)analysis，thebacteriastrainssamplechosenfromeach subclustersrandomlywererankedinto Firmicutes，Actinobacteriaand7-Proteobacteriathreegroups，andclosely relatedto Bacillus，Paenibacillus，Micrococcus，Arthrobacter，DietziaandPseudomonasgenera．Thedietziagenerawasreportedinthe sedimentofrfeshwaterlakeinChinaforthefirsttime． Keyword：LakeTaihu；sediment；culturablebacteria；numericaltaxonomy；diversity 湖泊沉积物的环境效应是水环境研究的重点之一，所关注的主要问题包括沉积物 “源”、 “汇”转换 的时空变化 ”【，对污染物的吸附和沉积，以及水一土界面的营养盐、污染物释放通量等2【-3】．除温度、pH值、 溶解氧(DO)、氧化还原电位(ORP)、水动力等物化因素之外llI4J，沉积物和上覆水体组成的二相结构界面