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蛋白质磷酸化位点的识别蛋白质磷酸化位点的识别
JOU RNAL OF INNER MONGOLIA
30 2 UNIVERSITY OF TECHNOLOGY Vol. 30 No . 2 2011
: 1001- 5167( 2011) 03- 0081- 05
*
白海艳, 吕 军, 张 颖, 计美珍, 秦丹丹
( 010051)
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CK2, PKA PKC
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, - ( Jensen- Shannon Divergence, JSD)
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CK2, PKA PKC 7- fold ,
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0 引 言
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( serine, S) , ( threonine, T ) ( tyrosine, Y) ( protein kinase,
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: 2011- 01- 19
* : ( 2010BS010 )
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2 109
[ 2]
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1999 , Blom[ 3] ,
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, ( Artificial
[ 3, ] [ 5, 6] [ 7]
Neural Netw ork, ANN) , ( Support Vector M achine, SVM) , K ,
( Hidden M arkov Model, HM M) [ 8] , ( logistic regression models) [ 9] ,
( position- specific scoring matrix , PSSM) [ 10] , ( Information- Entropy) [ 11] ,
( Bayesian decision theory, BDT) [ 12] , ( w eighted voting) [ 13] 2008 Zhang
( Increment of Diversity w ith Quadratic Discriminant analysis, IDQD) [ 1 ]
[ 15]
Basu 10 , ,
( ) ,
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(Jensen- Shannon Divergence w ith Quadratic Discriminant analysis, JSDQD)
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1 材料和方法
1. 1
[ 1 ] Phospho. ELM 6. 0
[ 16] , CK2( casein kinase 2) , PKA ( protein kinase A ) PKC
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