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Diamond作图
Company Logo Diamond作图 Diamond简述 一 描述复杂结构中原子的配位环境 二 描述三维孔状配位聚合物 三 四 描述具有螺旋结构的配位聚合物 目 录 * 气体存储 吸附分离 磁性材料 其他 催化 光学材料 MOFs Diamond的出现 MOFs 的广泛应用 引 * 绘制结构图 表现MOFs Diamond软件 MOFs 的研究过程 Shelxtl软件 产生cif文件 和晶体数据 X-射线单晶衍射 得到衍射数 据及衍射图 MOFs 晶体透明 晶型较好 Diamond的出现 引 * Diamond简介 Diamond是一种广泛使用的绘制晶体结构图的方法,它可清晰的描述MOFs的网络框架 Diamond使用 导入数据文件绘制晶体结构,进而表现性能※ 根据自己设计的模型构建出理想的结构 Diamond概述 一 * Diamond的主界面 打开数据文件 新建数据文件 浏览样品文件 使用说明 一 * Diamond的操作界面 一 * 孔洞结构 Diamond软件可以绘制的结构类型 层状结构 花瓣结构 嵌插结构 参考文献 [6-9] 一 返回 * 描述复杂结构中原子的配位环境 二 替代法:将复杂结构中的较大的配位基团用一个假原子代替 方法 删减法:将对描述结构无关的原子或基团隐藏,只显示一部分 * 举例 主体 [Co(H2O)6?Co8L12]6+ [HL = 4,6-di(2-pyridyl)-1,3,5-triazine-2-ol] 客体 多核水簇(H2O)21 其他 咪唑,KBr/KCl,EtOH 含有巨型离散水簇的笼状配合物 Man-Li Cao, J-J Wu, H-J Mo,etc,. J. AM. CHEM. SOC. 2009, 131, 3458–3459 二 * Co的多面体 结构分析 [Co(H2O)6?Co8L12]6+的结构 Co的配位 二 * Man-Li Cao, J-J Wu, H-J Mo,etc,. J. AM. CHEM. SOC. 2009, 131, 3458–3459 O原子组成的五角十二面体 结构分析 水簇的透视图 O3W O4W O5W O2W (H2O)21的结构 二 * Man-Li Cao, J-J Wu, H-J Mo,etc,. J. AM. CHEM. SOC. 2009, 131, 3458–3459 结构分析 配合物的3D氢键框架 [Co(H2O)6?Co8L12]6+ {Br6(H2O)14}6- {Cl6(H2O)16}6- 不规则阴离子 (H2O)21 二 * Man-Li Cao, J-J Wu, H-J Mo,etc,. J. AM. CHEM. SOC. 2009, 131, 3458–3459 结构分析 配合物的结构模型 [Co(H2O)6?Co8L12]6+ {Br6(H2O)14}/{Cl6(H2O)16} (H2O)21 二 * Man-Li Cao, J-J Wu, H-J Mo,etc,. J. AM. CHEM. SOC. 2009, 131, 3458–3459 Diamond作图得到的结构及性能信息 水簇较大,比设计的理论模型(3.9埃)还大 1 2 3 水簇是有规律的分散排布,靠氢键与主体连接 主体分子及客体分子的周围环境 二 返回 * Man-Li Cao, J-J Wu, H-J Mo,etc,. J. AM. CHEM. SOC. 2009, 131, 3458–3459 描述三维孔状配位聚合物 三 堆积法 模型法 插球法 参考徐金金硕士论文 * 举例 三 三维孔状配合物[H3O][In2(btc)(bdc)(OH)2]·5.5H2O btc=1,2,4-苯三甲酸 bdc=1,4-对苯二甲酸 [H3O][In2(btc)(bdc)(OH)2]·5.5H2O的单体结构图 Han, Z.-B.; Yong-JuanSong; Jian-WeiJi Journal of Solid State Chemistry 2009, 182, 3067. * 结构分析 [H3O][In2(btc)(bdc)(OH)2]·5.5H2O的结构图 三 3D孔洞结构 2D管状结构 1D Z字型结构 Han, Z.-B.; Yong-JuanSong; Jian-WeiJi Journal of Solid State Chemistry 2009, 182, 3067. 返回 * (a) (c) (b) 描述具有螺旋结构的配位聚合物 四 (a)空间堆积型 (b)直线型 (c)球棍型 (d)孔洞型 参考文献 [13-14] * 举
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