NCHCALPSLSF简易使用说明.PDF

NCHC ALPS LSF 簡易使用說明 一 、工作目錄 ：/work 使用者自行在上述工作目錄區建立自己的資料夾。 二、計算節點群組說明 ： NCHC ALPS 使用的Queueing system 是Platform 的LSF ，目前使用的版本是7.05 。 目前設有serial 、12cpu 、48cpu 、192cpu 、384cpu 、768cpu 、short 、medium 、long 等9 個queue 。其中serial 為單CPU 的job ，12CPU 的queue 可允許2~12cpus ，48CPU 的queue 可允許13~48cpus 的job 、192CPU 的queue 可允許49~192cpus 的job 、 384CPU 的queue 可允許 193~384cpus 的job 、768CPU 的queue 可允許385~768cpus 的jobs ，short 、medium 與long 等三個 queue 最大都可執行到128 cpus 的job ，short 執行時間最長為2 天、mediu 最長為4 天、long 最長為10 天，如表1 。 表 1. Queue Name CPU(s)/job Max CPUs/user (CPU/Run)time limit/job serial 1 20 12 days 12cpu 2~12 120 8 days 48cpu 13～48 240 6 days 192cpu 49~192 768 5 days 384cpu 193~384 768 3 days 768cpu 385~768 1536 2 days short 128 128 2 days medium 128 128 4 days long 128 128 10 days 三 、操作說明 1. 環境變數設定 當您登入系統時，預設的環境已經將LSF 的環境變數載入，因此您不需再做任 何設定。若未載入LSF 環境，可依下列方式載入。 csh/tcsh ： %source /pkg/lsf/cluster5/conf/cshrc.lsf （%為提示符號） sh/ksh/bash ： $. /pkg/lsf/cluster5/conf/profile.lsf （$為提示符號） 2. 基本指令說明 基本操作的幾個指令為，bsub 、bqueues 、bhosts 、bjobs 、bkill 、bhist 、bacct  bsub 為LSF submit job 指令，常用的參數如，-n -q -o -e -J (optional) -n ：指定使用cpu 數目（可省略，預設是1 ） -q ：指定使用queue 的名稱（可省略，預設是serial ） -o ：指定stdout 的輸出檔案（可省略，預設是$job_id.out ） -e ：指定stderr 的輸出檔案（可省略，預設為$job_id.err ） -J ：指定Job 名稱（可省略，預設為執行指令） 如： bsub ./my_program bsub -n 1 -q serial -o output.txt -e error.txt -J TEST ./my_program bsub -n 4 -q 12cpu /work/jobs bsub -n 8 -q 12cpu my_8cpu_job 上述前兩例的結果是一樣的