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广西地方标准《H10N8亚型禽流感病毒检测 多重反转录聚合酶链(RT-PCR)检测法》(征求意见稿)
ICS11.220
B 41
DB45
广西壮族自治区地方标准
DB 45/T XXXXX—2016
H10N8亚型禽流感病毒检测 多重反转录聚合酶链检测法
Detection of H10N8 subtype Avian Influenza Virus by Multiple Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction Method
点击此处添加与国际标准一致性程度的标识
(本稿完成日期:2015年11月20日) 2016 - XX - XX发布
2016 - XX - XX实施
广西壮族自治区质量技术监督局发布
前言
本标准。H10N8亚型禽流感病毒检测 多重反转录聚合酶链检测法
范围
本标准规定了多重反转录聚合酶链反应法检测的H10N8亚型禽流感病毒的术语和定义、材料与试剂、仪器设备和消耗品、操作方法、结果判定及废弃物的处理。
本标准适用于H10N8亚型禽流感病毒的检测。
术语和定义
下列术语和定义适用于本标准。Mg2+存在的条件下,依赖于Taq DNA聚合酶的酶促反应。又称无细胞分子克隆或特异性DNA序列体外引物定向酶促扩增技术,简称PCR技术。
引物primer(p)
指分别与待扩增DNA片段两侧互补的一小段(约20 bp)寡核苷酸。
特异性引物specific primer(SP)
针对特定DNA片段在其两侧设计合成的一小段互补寡核苷酸,在PCR反应中与DNA模板特异性结合。它决定了PCR扩增产物的特异性。
多重RT-PCR反应 reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR)
是一种特殊RT-PCR形式,其最突出特点,通常是指在同一反应体系中加入多对引物,扩增同一模板的几个区域,即一次PCR反应,可同时检测、鉴别出多种病原体。
材料与试剂
H10N8亚型AIV特异性引物
根据H10N8亚型AIV HA基因和和NA基因序列,分别设计了用于扩增HA和NA基因的两对特异性引物HA1、HA2和NA1、NA2。引物HA1和HA2扩增HA目的片段大小为267 bp,引物NA1和NA2扩增NA目的片段大小为464 bp,引物的使用浓度为μmol/L。根据附录A中A.1.1给出的引物寡核苷酸序列送测序公司合成。使用前先用灭菌双蒸水稀释,置-20 ℃保存备用,避免反复冻融。
试剂
RNA抽提试剂
RNA 抽提试剂如下:
Trizol RNA抽提试剂;
氯仿;
异丙醇;
75℅乙醇(DEPC水配制)。
Trizol? RNA抽提试剂(商品名)是由Invitrogen公司(供应商)提供的产品的商品名。给出这一信息是为了方便本标准的使用者,并不表示对该产品的认可。如果其它等效产品具有相同的效果,则可使用这些等效产品。
RT-PCR试剂盒
RT-PCR试剂盒如下:
Taq DNA聚合酶;
反转录酶;
RNA酶抑制剂;
随机引物;
dNTPs 混合物:dATP、dTTP、dCTP、dGTPPCR缓冲液(含Mg2+)。
试剂盒包含了RNA反转录以及PCR扩增所必需的各种酶、dNTPs及Mg2+等全部试剂。可向多个生物工程公司购得,使用时按本标准给出的量使用。
电泳试剂
电泳试剂如下:
1℅琼脂糖溶液;
10 mg/mL GoldView染料;
加样缓冲液;
1倍TAE电泳缓冲液。
其他试剂
其他试剂如下:
灭菌双蒸水;
磷酸盐缓冲液(PBS pH7.2);
DEPC水PCR仪;
电泳仪;
紫外检测仪;
凝胶成像系统;
小型高速离心机;
旋涡振荡器;
研钵或玻璃研磨器;
微量加样器;
超净工作台;
手套;
离心管;
PCR反应管;
吸头。
操作方法
注意事项
整个操作应在一个无RNA酶污染的环境下进行,所以整个操作过程宜在超净工作台中进行,戴口罩并使用一次性手套。
玻璃器皿常规洗净后,用终浓度为0.1% DEPC水2 h。倒去浸泡的DEPC水1.034×105 Pa 高压灭菌30 min,经50 ℃烘烤4 h 以上或100 ℃ 干烤15 min。
离心管、PCR反应管、微量加样吸头应使用一次性无RNA酶的塑料制品,使用前经1.034×105 Pa 高压灭菌30 min。所有参与反转录的溶液用DEPC处理过的水配制。
DEPC水的制备见附录B中B.4。
样品的准备
样品的采集和预处理
粪便和口鼻分泌物
用棉拭子采取待检家禽或野鸟的粪便、口鼻分泌物,经含有青、链霉素(各10000单位/mL)的PBS溶液稀释,650 g离心10 min,取上清250 μL供总RNA抽提或置-70 ℃ 保存备用。
病料组织
取患病家禽或野鸟的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胰脏和气管样品约各1g,置于研钵或玻璃研磨器中,加入适量的含
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