基因序列分析综合报告 陈川.ppt

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基因序列分析综合报告 陈川

基因序列分析综合报告 Gene Sequence Analysis Comprehensive Report * 2011602124 陈川 研究意义 数据获取 序列比对 结果分析 讨论 参考文献 报告内容 研究意义 p53是一种肿瘤抑制基因。 在所有恶性肿瘤中,50%以上会出现该基因的突变。由这种基因编码的蛋白质是一种转录因子,其控制着细胞周期的启动。许多有关细胞健康的信号向p53蛋白发送。关于是否开始细胞分裂就由这个细胞决定。 如果这个细胞受损,又不能得到修复,则p53蛋白将参与启动过程,使这个细胞在细胞凋亡中死去。有p53缺陷的细胞没有这种控制,甚至在不利条件下继续分裂。像所有其它肿瘤抑制因子一样,p53基因在正常情况下对细胞分裂起着减慢或监视的作用。 细胞中抑制癌变的基因“p53”会判断DNA变异的程度,如果变异较小,这种基因就促使细胞自我修复,若DNA变异较大,“p53”就诱导细胞凋亡。    p53是重要的肿瘤抑制基因,自从该基因在1979年被首次报道以来,有关研究论文在Medline上可查到20000余篇。人们最初认为p53基因是一种癌基因,但随着近十年研究的深入,p53作为抑癌基因的功能逐渐被揭示出来。 在人类50%以上的肿瘤组织中均发现了p53基因的突变,这是肿瘤中最常见的遗传学改变,说明该基因的改变很可能是人类肿瘤产生的主要发病因素。    p53基因突变后,由于其空间构象发生改变,失去了对细胞生长、凋亡和DNA 修复的调控作用。p53基因是迄今发现与人类肿瘤相关性最高的基因,在短短的十多年里,人们对 P53基因的认识经历了癌蛋白抗原,癌基因到抑癌基因的三个认识转变。 数据获取 登陆美国国家生物信息中心 NCBI  选择核酸数据库  输入要查询的基因p53 获取人类和亚洲水牛的p53基因 查找相应的GenBank FASTA Graphic格式 人类的p53基因 亚洲水牛的p53基因 序列比对 进入BLAST界面 输入要比对的序列号 JF923569.1和JF792632.1 参数选择 默认参数 进行BLAST双序列比对 结果分析 比对分析结果 Graphic Summary Dot Matrix View Descriptions Alignments 结果讨论 两者比对得分是167,匹配的序列占54% 人类的p53基因与亚洲水牛的p53基因相似度为84% 可以通过研究亚洲水牛来研究人类肿瘤免疫研究工作 之前我做的是COX-2和HER2,但是得不到比对结果 没有得到显著相似性,请问是什么地方出现错误? 错误详见 Search Summary * * *

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