Centos5.0建立pc集群总结.doc

Centos5.0建立pc集群总结1 湖南大学物理与微电子科学学院（1） Samuel 2007,10,21 （1）注：本人工作，引用请注明出处 准备工作：设置IP，更改主机名为node01,node02,node03,node04.本说明首先建立一个集群然后讲述vasp和matlab的并行安装。其中包括nis和nfs的配置问题和linux上网问题的解决。第一章 安装mpich2 一、创建SSH信任连接（在root目录下）1、更改/etc/hosts文件（ipv6去掉）#vi /etc/hosts 打开hosts文件，更改如下：127.0.0.1 localhost.localdomain localhostnode01的IP scc-mnode01的IP node01node02的IP node02node03的IP node03node04的IP node042、在node01生成SSH秘钥对（root用户或者一般用户，建议一般用户，在一般用户下步骤同下）.#ssh-keygen -t rsa 一路回车即可产生.ssh文件,#ls -a 查看是否有.ssh文件夹3、进入.ssh目录#cd .ssh4、生成authorized_keys文件#cp id_rsa.pub authorized_keys 5、退出到root目录#cd ..6、建立本身的信任连接#ssh node01 按提示输入yes（三个字母要打全）7、设置node02（node02的root目录下）#ssh-keygen -t rsa 生成.ssh文件夹#scp node01的IP：/root/.ssh/* /root/.ssh 拷贝node01上的.ssh文件夹覆盖本地的#scp node01的IP：/etc/hosts /etc/hosts 拷贝node01上的hosts文件覆盖本地的#ssh node01 提示处输入yes回车设置node03,node04的方法与node02相同8、确认四台机器的信任连接已建立对每个节点执行：#ssh node01#ssh node02#ssh node03#ssh node04在提示处输入yes回车，最后确定无需输入密码并且没有任何提示信息即可登陆（Last login:时间日期提示信息除外）二、安装MPICH2(在节点root目录下)1、解压缩#tar -zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz或者 #gunzip -c mpich2-1.0.1.tar.gz|tar xf mpich2-1.0.1.tar 或tar zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz2、创建安装目录#mkdir /opt/mpich23、进入mpich2解压目录#cd mpich2-1.0.14、设置安装目录#./configure --prefix=/opt/mpich25、编译#make6、安装#make install7、退出到root目录#cd ..8、通过编辑.bashrc文件修改环境变量#vi .bashrc修改后的.bashrc文件如下：# .bashrc# User specific aliases and functions alias rm=rm -ialias cp=cp -ialias mv=mv -iPATH=$PATH:/opt/mpich2/bin 新增加的 或者export PATH=/opt/mpich2/bin:$PATH#Source global definitionsif [ -f /etc/bashrc ]; then. /etc/bashrcfi注明：一般用户vi .bashrc加入export PATH=/opt/mpich2/bin:$PATH，然后. .bashrc更新环境9、测试环境变量设置#which mpd#which mpicc#which mpiexec#which mpirun10、修改/etc/mpd.conf文件，内容为secretword=myword#vi /etc/mpd.conf设置文件读取权限和修改时间#touch /etc/mpd.conf#chmod 600 /etc/mpd.conf11、创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts#vi mpd.hosts文件内容如下：node01node02node03node04三、测试1、本地测试#mpd 启动#mpdtrace 观看启动机器#mp