玉筋鱼微卫星标记的筛选及种群SSR分析.pdf

玉筋鱼微卫星标记的筛选及种群SsR分析 玉筋鱼微卫星标记的筛选及种群SSR分析 捅 要 玉筋鱼(彳mmo碍脚spe船D凇f淞Girard)属玉筋鱼亚目、玉筋鱼科、玉筋鱼 属，俗称面条鱼、沙钻，为冷温性小型鱼类，我国的渤海、黄海北部及朝鲜半岛、 日本和俄罗斯远东海区都有分布。为研究玉筋鱼的群体遗传结构，本研究采用富 集文库法构建玉筋鱼的部分基因组文库，根据自行分离得到的序列设计引物，11 对引物扩增出条带清晰，多态性高的目的片段。利用其中的的6对引物(和P104， 石狩湾5个群体进行群体遗传多样性研究。论文主要研究结果如下： 1．提取玉筋鱼基因组DNA，利用富集文库法构建其基因组文库，筛选得到 88条含微卫星的序列，根据序列设计的31对引物中，11对可以扩增出典型的微 卫星条带。利用36个个体对能够扩增微卫星条带的位点进行PCR扩增，结果显 示11对引物均具有较高的多态性。多态性引物中，扩增出的等位基因数目从8 到27个不等，平均等位基因数目为14．9，观测杂合度和期望杂合度分别为O．441 到0．886和O．818到0．965。 ． 2．在本研究中，6对微卫星引物在5个群体中共扩增得到124个等位基因， 等位基因数在9．27之间，平均每个位点得到20．7个等位基因。有效等位基因数 在6．7．22．4之间，平均每个位点检测到15．7个有效等位基因。五个群体的平均观 测杂合度在0．60．0．86之间，平均期望杂合度介于O．84．O．92之间。六个位点均有 较高的多态信息含量(PIC)，其值介于O．83一O．95之间。 3．根据Nei(1972)计算种群间标准遗传距离和遗传相似性系数。玉筋鱼5 2个群体间遗传变异程度最高，亲缘关系最远；石狩湾(Ishikari Bay)与礼文岛 (RebuIl IslaIld)的遗传相似性系数最大，遗传距离最近。其聚类关系树将5个 群体分为2支。福冈，爱知，青岛群体聚为一支，礼文岛与石狩湾群体(属于其 研究的北部玉筋鱼群体)聚为一支。 部群体即石狩湾和礼文岛之间的遗传分化指数为O．0078；显著性水平大于O．05。 lll 玉筋鱼微卫星标记的筛选及种群SsR分析 南部群体和北部群体之间的遗传分化指数在O．0265．O．0365之间，显著性水平均 ver3．01软件，计算南北组群之间的遗传分化系数为 小于0．01。利用心1equin 0．0143，而组群内部之间的遗传分化值为O．0139。圳OVA分析结果显示玉筋鱼 南北组群之间的变异占1．43％，相应的组群内部之间的变异为1．39％；而来自个 体之间的变异贡献率95．19％。组群之间的遗传分化与群体之间的遗传分化基本 一致，证明玉筋鱼5个群体仍处于种内水平的变异。 关键词：玉筋鱼；微卫星；多态性；遗传分化 IV 玉筋鱼微卫星标记的筛选及种群ssR分析 Microsatemte andGenetic Marke瑙Devdopment iⅡsand Dive礴i锣Researchlance似撒刀加翻蜘坊p盯鲫刀口删 Abstrac忸 111esaIld cold-temperatespecies，is谢dely l锄ce，彳聊聊D批s俨憎D门口觚G油畦a distributediIltlleBoSea、廿1enonhemYellow Sea，Korea t0 the Russ