猪伪狂犬病病毒蛋白激酶基因的克隆及其部分生物信息学分析.pdf

1032 　中 国 兽 医 学 报 　20 10 年 8 月 　第 30 卷 　第 8 期 　Chi n J Vet S ci 　Aug . 20 10 　Vol . 30 　No . 8 　 猪伪狂犬病病毒蛋白激酶基因的克隆及其部分生物信息学分析 ( 张 　博 ,郭万柱 ,邹蔚然 ,徐志文 ,王 　印 ,王小玉 　 四川农业大学 动物医学院 动物生物技术中心 , 四川 雅安 6250 14) ( ) ( ) 摘要 :采用 PCR 方法扩增出 12 株伪狂犬病病毒 PRV 的蛋白激酶 Prot ein Kina se , P K 基因全序列 ,并测序 ,使用 生物信息学软件对这 12 株 PRV 的 P K 基因序列以及 GenBank 登录的6 条 P K 基因序列进行了生物信息学分析和 预测 。结果显示 ,PRV P K 基因开放阅读框的核苷酸长度为 1 107～1 170 bp ,氨基酸长度为 368～389 个 ;核酸和 氨基酸的同源性分别为 96 . 7 %～100 %和 73 . 9 %～100 % ;在 P K 基因核酸序列 1 079～1 099 bp 和 240～250 bp 处 有 2 个高变重复区;蛋白质疏水性 、抗原表位的分析结果十分相似 ,而且 P K 基因编码的蛋白质均具有真核细胞丝 氨酸/ 苏氨酸蛋白激酶催化结构域的保守氨基酸共有序列和亚结构域特征序列 。结果表明 , PRV P K 基因在大部 分毒株具有较高的保守性 。 关键词 :伪狂犬病病毒 ;蛋白激酶基因;序列分析 ;生物信息学 中图分类号 :S852 . 65 　　　文献标识码 :A 　　　文章编号 :(20 10) Cloning of protein kinase genes of procine pseudorabies viruses and analyses of their partial bioinf ormatics ( 　 ZHAN G Bo , GU O Wanzhu , ZOU Weiran , XU Zhiwen , WAN G Yin , WAN G Xiaoyu 　 A ni m al B iotech nolog y Center Col leg e of Veteri na ry M e d ici ne , S ich u an A g ricul t u ral Uni ve rs i ty , Ya ′an , ) S ich u an 6250 14 , Chi n a Abstract : The fulllengt h P K genes of 12 st rain s of p seudorabies viru s ( PRV) were amplified by PCR ,sequenced ,ana lyzed and t hen p redict ed wit h 6 P K gene sequences available in GenBank by bioinformatics software . The op en r