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blastGO教程
blast2GO简易教程首先点file,Load,Load sequences(eg:fasta)导入数据,要fasta格式的,如图所示。选择导入的文件。然后选择导入的类型。是核算序列就选核算序列这个选项。然后点Load点blast,再run blast选择数据库。默认就行输入你的邮箱,核酸选blastx,其余默认选默认选工作运行文件储存位置后,点run。运行的时间可能比较长,视你的数据量而定。Blast结束后,点OK。再点Mapping,再点run mapping。Mapping结束后,再点annot这个按钮,点Run annotation。选项默认就行。一直点NEXT,最后显示出RUN,点击它。当运行完毕后,点Aanlysis,再点GO SLIM,再点run go-slim。默认就行。点run运行完毕后,点analysis下的run go-enzyme-code mapping。运行完毕后,点interro,run interproscan都选上也行。点next选择文件保存的位置。点RUN运行完毕后,点图上所示merge interproscan。这样就运行完了。你可以点相应的按钮,保存就点右下角TXT或PDF等按钮,保存为相应格式。也可以做进一步分析。如果中途没跑完,点file中的save project,下次直接导入可继续。Charts按钮是作图用的,你可以随意点,然后就可以做相应的图后续都选上也行。运行后的结果都在这个区域内。点不同的按钮显示不同结果。点graphs,再点make combined graphs,默认就行。点run。点TXT就后保存为后面样式的文件。这样就有GO序列号致谢陈帅师姐给予的指导!
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