生物化学原理教学（杨荣武）生化期末复习整理.docVIP

第一章 绪论 一、掌握： 1. 生物化学的定义。 生物化学：又称生物的化学或生命的化学。是一门研究生物体的化学组成、体内发生的反应和过程的学科。 第二章 　蛋白质结构与功能 一、掌握： 1. 构成蛋白质的20种氨基酸的结构特点、分类及三字符号。 1.苯环:Phe；2.酚羟基:Tyr；3.吲哚环:Trp；4.羟基:Ser,Thr；5.硫:Cys,Met；6.胍基:Arg；7.咪唑基:His；Asp＋Glu/Asn+Gln 2. 肽键和肽的概念、结构特点。 A肽键peptide bond：蛋白质分子中的主要共价键，是连接两个氨基酸的酰胺键，由一个羧基和一个氨基脱水缩合而成 结构特点：单键形式，部分双键性质； 难以旋转, 有刚性→肽键平面 肽键平面: 由连接肽键两端的C=O、N-H和2个C六个原子组成，空间位置在相对接近的一个平面上 B肽、寡肽与多肽peptide, oligopeptide, poly peptide：氨基酸通过肽键相连的化合物，蛋白质不完全水解的产物也是肽。一般含有几到十几个以下氨基酸组成的肽称为寡肽。由十几个以上氨基酸组成的称为多肽。 结构特点：多肽有开链肽(人体)和环状肽；含有氨基酸残基。 肽链的N-/C-端N-/C-terminal：开肽链具有一个游离的氨基末端和一个游离的羧基末端，分别保留有氨基酸游离的α-氨基和α-羧基没有被结合掉，又称为肽链的N端（氨基端）和C端（羧基端）。 3. 蛋白质一级结构的概念及其重要性。 蛋白质的一级结构Primary Structure：专指多肽链中氨基酸(残基)排列的序列。即蛋白质分子中由共价肽键相连的基本分子结构，同时也包括二硫键。 一级结构的重要性：1、空间结构和生理功能的基础；2由序列中不同氨基酸残基侧链R的大小、性质不同决定；3、关键活性部位氨基酸残基的改变→影响其生理功能→甚至分子病。3、蛋白质与DNA分子具有“共线性”关系，DNA→蛋白质一级结构→遗传特征，认识阐明生理功能的分子基础。 4. 分子病的概念。 分子病Molecular diseases：蛋白质一级结构改变引起的功能异常或丧失造成的遗传病。 5. 二级结构的概念和不同的二级结构单元的特点。 蛋白质的二级结构Second structure：指多肽链中相邻氨基酸残基形成的局部肽链空间结构，主要是主链原子局部空间排布。 α-螺旋α-helix,H：1、由肽键上的C、N原子与氨基酸残基中的α碳原子交替→肽链主链，N→C右手螺旋结构；2、3.6aa/螺旋,螺距0.54nm，13原子/螺旋(3.613)；3、氢键3个/相邻螺旋，与螺旋纵轴平行，α螺旋的主要稳定因素；4、R基团位于螺旋外，不参与螺旋组成,但影响螺旋形成与稳定；5、稳定的蛋白质空间构象＝最稳定的二级结构；5、不同比例 β-片层结构/折叠β-pleated sheet structure：1、肽链中比较伸展的空间结构；2以氢键维系，3、肽键平面间成锯齿状（110°）。 β-转角β-turn,T：1、“U”型结构(肽链1800回折)；2、氢键: (aa1)C=O---H-N(aa4) ，较α螺旋紧密；3、大多存在球蛋白 π-螺旋π-helix：，1、左手螺旋，4.4aa/螺旋；2、氢键维系；3、多见于胶原蛋白分子；4、三股左手螺旋盘绕→右手超螺旋缩合→胶原纤维 随意卷曲randon coil：又称无规律卷曲，1、是各不相同，无共同规律的空间结构，是蛋白质中一系列无序构象的总称；2、普遍存在于天然蛋白质中，特征性二级结构。 6. 超二级结构和结构域的概念。 蛋白质的超二级结构Super secondary structure：蛋白质分子中的一些二级结构单元（1分），有规则地聚集在一起形成相对稳定的αα、βββ、βαβ、β2α和αTα等超二级结构（2分），又称模体(motif)或模序。 结构域structural domain：单个或者多个超二级结构，尚可与二级结构进一步集结起来，形成在蛋白质分子空间结构中明显可区分的区域。 7. 三级结构的概念及特点。 蛋白质的三级结构 Tertiary structure：整条多肽链中所有氨基酸残基，包括相距甚远的氨基酸残基主链和侧链所形成的全部分子结构。 特点：1、三级结构可以是球、椭圆、棒、纤维状等；2、可形成亲水表面和疏水内核；3、表面也可形成沟,穴 (结合辅助因子), 肌红蛋白 - 血红素(Fe2+) 酶 - 底物 抗原 - 抗体 8. 四级结构、亚基概念及特点。 蛋白质的四级结构Quaternary stucture：指各具独立三级结构多肽链再以各自特定形式接触排布后，集结形成的蛋白质最高层次空间结构。 亚基Subunit：四级结构中，各具独立三级结构的多肽链，单独存在时不具生物活