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清华大学《生物化学》课件第一章 蛋白质化学
纤维状蛋白的构象 角蛋白(keratin) 丝心蛋白(也称丝蛋白,fibroin) (一)简单蛋白 完全水解的产物全部为α-氨基酸,说明分子中只由α-氨基酸组成。 教材P36,表1-10。 (二)结合蛋白 由简单蛋白和非蛋白组分两部分组成,非蛋白质部分称为辅基。根据辅基的不同,结合蛋白可以分为5类:核蛋白、糖蛋白与蛋白聚糖、脂蛋白、色蛋白、磷蛋白。 1.核蛋白(nucleoprotein) 由蛋白质和核酸(DNA或RNA)组成。存在于所有细胞里,细胞核里的核蛋白(染色体)是由DNA和组蛋白(His)结合而成。 细胞核中的核糖体(ribosome)就是由RNA和蛋白质组成的。 病毒(virus)全部是核蛋白。 2.糖蛋白(glycoprotein)和聚糖蛋白 由蛋白质和糖通过共价键相连而成。 连接方式:O-连接和N-连接。 功能:催化、运载、免疫、激素、保护、信号传导。 生物膜上的糖蛋白 例2 细胞色素C(cytC) 广泛存在于需氧生物细胞的线粒体(mitochondrion)中,是一种与血红素辅基相结合的单链蛋白质,在生物氧化中起重要作用。 亲缘关系越近cytC组成和结构的相似性越大,从而为生物的进化提供了证据。 与功能密切相关的氨基酸序列是不变的。 表1-6 不同生物与人的细胞色素c相比较的氨基酸差异数目 2.分子病 蛋白质一级结构中的氨基酸排列顺序与正常有所不同的遗传病。 如非洲人中流行的一种镰刀型贫血病(sickle-cell anemia),是由于病人的血红蛋白(Hb-S)与正常人的血红蛋白(Hb-A)相比有两个氨基酸的差异引起的。 正常红细胞呈双凹型,无 氧状态下仍然分散;异常 呈镰刀型,无氧状态下呈 聚集分布。 β-链的第6位氨基酸(Glu)被Val所取代 (二)蛋白质构象与功能的关系 别构现象(allosteric effect):蛋白质的构象并不是固定不变的,当有些蛋白质的表现其生物活性时,其构象发生改变,从而改变了整个分子的性质,这种现象就称为别构现象(别构效应、变构效应)。具有这种现象的蛋白质叫别构蛋白。 S-形(S-shaped)氧合曲线 脱氧Hb对氧的亲和能力低于单独的α-或β-亚基,也低于Mb。随着氧浓度的增加,当氧首先与其中一个α-亚基结合以后,该亚基的构象发生变化,又引起另外3个亚基的构象发生变化,亚基间的次级键破坏,分子的空间构象发生改变。所有亚基血红素铁更容易与氧结合,因而Hb与氧的结合速率大大加快。 Rectangular hyperbola Sigmoid (S-shaped) 2.8 26 7.5 torr = 1 kPa P50 of Mb P50 of Hb pO2 in lung pO2 in tissue 0.50 S-形曲线和波尔效应(Bohr effect) 血红蛋白在肺部和组织中的氧合能力。 H+、CO2和有机磷酸(二磷酸甘油酸,DPG)等促进HbO2释放O2 ,这称为波尔效应。 波尔效应 七、蛋白质的性质 (一)蛋白质的相对分子量 蛋白质的相对分子量很大,一般在1,0000-1,000,000之间。 蛋白质(包括核酸)的分子量常用S表示。 沉降系数(sedimentation coefficient) :一般是指单位(cm)离心场里的沉降速度称为沉降系数,用S表示,一个S为1×10-13秒 。 (二)蛋白质的两性电离及等电点 蛋白质也是两性电解质。 能解离的基团除α-氨基和α-羧基以外,还有侧链的ε-氨基、β-羧基、γ-羧基、咪唑基、胍基、酚基、巯基等。 蛋白质的两性解离 pH=pI pHpI pHpI 蛋白质的等电点与其氨基酸的种类和数量有关。如鱼精蛋白(12-12.4)、胃蛋白酶(1-2.5)。 等电点时蛋白质溶解度最小,容易聚集而沉淀。因此,可利用此特性进行分离、提纯。 电泳(electrophoresis) 带电的大分子化合物在电场中移动(与带电荷相反)的现象称为电泳。 蛋白质分子电泳的方向和速度取决于其带电性、电荷多少、分子量以及颗粒大小。 电泳法常用于混合蛋白质的分离和提纯。 (三)蛋白质的胶体性质 蛋白质相对分子量大,在水溶液中的形成的颗粒具有胶体溶液的特征(布朗运动、丁道尔现象、电泳现象、不能透过半透膜以及具有吸附能力等)。 透析(dialysis):将混有小分子杂质的蛋白质通过半透膜进行纯化的过程,称为透析。 蛋白质形成稳定的亲水胶体的原因:水化层和所带电荷。 (四)蛋白质的沉淀反应 1.加高浓度盐类 盐析(salt out):高浓度盐可以破坏蛋白质胶体周围的水膜,同时又中和了蛋白质分子的电荷,因此使蛋白质产生沉淀,这种加盐使蛋白质沉淀析出的现象,称盐析。如点卤。 2.加有机溶剂 破坏蛋白质的亲水层。 3.加重金属盐 碱性溶液中与重金属离
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