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1.1 DNA与染色体;中心法则
(the central dogma);1.2 DNA复制;一、DNA复制的半保留性
二、复制过程的顺序性
三、DNA的半不连续复制
四、复制起点和复制子
五、复制的方式
;1、Waston Crick(1953);DNA复制的三种可能的方式;1958年 Meselson stahl
同位素示踪标记 密度梯度离心技术;一、DNA复制的半保留性
在DNA复制时,亲代DNA的双螺旋先行解旋分开,然后以每条链为模板,按碱基互补配对原则,在这两条链上各形成一条互补链,这样从亲代DNA的分子可以精确地复制成2个子代DNA分子,每个子代DNA的一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合成的。
这种复制方式称为半保留复制(semiconservation replication)。;;二、DNA的半不连续复制 ;二、DNA的半不连续复制 ; 这种前导链的连续合成和滞后链的不连续合成称为DNA合成的半不连续复制(Semi-discontinuous replication)。;三、复制过程的顺序性
双螺旋DNA是先全部解开成两股单链,然后分别作为模板合成新链,还是边解开边合成的? ;三、复制过程的顺序性;四、复制起点和复制子
复制起点
Origin of replication
DNA复制在生物细胞中要从DNA分子上特定位置开始,这个特定位置称为复制起点,用ori表示。;复制子(replicon):
生物体DNA复制的单位
DNA复制从起点开始双向进行直到终点为止,每一个这样的DNA单位称为复制子。
包括复制起始位点和终止位点。
;E. Coli
环形DNA
单复制子
θ复制;E coli 复制原点oriC;复制终止区terminus region(ter);真核生物的基因组中有多个复制起点;有富A-T的11 bp保守区;复制起点的一般特征;在不同的物种中,DNA复制可以采用不同的方式。
环状双链DNA的复制根据复制叉的形状特点(如单向还是双向),具体可分为几种类型:
θ型复制
滚环复制
D环复制
;DNA复制的方式;DNA复制的方式;滚环(Rolling circle)复制 ;;滚环复制;进行滚环复制的DNA分子类型:;φX174 DNA的合成 ;D环(D-loop)复制
单向复制的特殊方式。
线粒体和叶绿体DNA的复制采取这种方式。
特点
两条链的复制不同步
两条链的复制在不同的地方起始
;双链DNA解链;;1.2.2 DNA复制所需的酶和其它蛋白质;一、DNA聚合酶(DNA Polymerase,DNA pol)
1956年由A.Kornberg首先在大肠杆菌中发现DNA聚合酶,又称Kornberg酶。
以后随着研究的深入,人们又发现了另外两种DNA聚合酶,为了区别,人们把Kornberg酶称为DNA聚合酶Ⅰ,另两种分别称为DNA聚合酶II和DNA聚合酶III。;5′-3 ′聚合酶作用
在RNA/DNA的3’-OH末端,以dNTP为底物,按模板DNA上的指令由DNA pol逐个将核苷酸加上去,就是DNA pol的聚合作用。;3’→5’外切酶活性
主要功能是校对作用,在正常聚合条件下,3→5外切酶活性很低,一旦出现碱基错配,则聚合反应停止,由3→5外切酶将错配的核苷酸切除,以便重新在这个位置上聚合对应的核苷酸。可见,3→5外切酶活性对DNA复制真实性的维持是十分重要的。;5’→3’外切酶活性;1、DNA聚合酶Ⅰ(DNA polymeraseⅠ,DNApolⅠ);结构特点
1、由18个?-螺旋区组成;
2、蛋白酶水解产生2个片段:
小片段:有5`?3`外切酶活性
大片段:有DNA聚合酶活性及3` ?5`外切酶活性。;生物学功能
DNA的修复--------3’→5’外切酶活性
5’→3’聚合作用
RNA引物的替换----5’→3’外切酶活性;切刻平移(Nick translation)
DNApolⅠ的5→3DNA聚合酶活性和5→3外切酶活性协同作用,可以使DNA链上的切口向前推进,即没有新的DNA合成,只有核苷酸的交换。;在DNA分子克隆中
Klenow聚合酶的主要用途:
修补经限制酶消化的DNA所形成的3′隐蔽末端;
双链DNA 5突出(5overhang)末端的补平(fill-in);
双链DNA 3突出(3overhang)的打平(也称削平);
标记DNA片段的末端;
cDNA克隆中的第二链cDNA的合成;
DNA序列测定。; DNApolⅠ是第一个被鉴定的DNA聚合酶,但它不是在大肠杆
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