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第8章_核酸的降解和核苷酸的代谢
第八章 核酸的酶促降解和核苷酸代谢 第一节 核酸的酶促降解 一、核酸酶 (1)外切核酸酶 (2)内切核酸酶 二、限制性内切酶 常用的DNA限制性内切酶的专一性 1. 限制性内切酶类型 2. 限制性内切酶的命名和意义 嘌呤的分解 一、核糖核苷酸的生物合成 1. 嘌呤核苷酸的从头合成途径 IMP的生物合成 2. 嘌呤核苷酸合成补救途径 嘧啶核苷酸从头合成途径 嘧啶环上各原子的来源 尿嘧啶核苷酸合成途径 脱氧核苷酸的合成 核糖核苷酸的还原反应 脱氧胸腺嘧啶核苷酸的合成 核苷酸的合成及相互关系 补充内容:氨基酸与一碳基团代谢 一碳基团 叶酸和 四氢叶酸(FH4) 一碳基团的来源与转变 1、一碳基团(一碳单位)的概念 2、一碳基团和氨基酸代谢 Gly、Ser、Thr、His都可以作为一碳基团的供体。 3、一碳基团的利用:参与合成反应, 如磷脂、核苷酸等的合成。 在代谢过程中,某些化合物(如氨基酸)可以分解产生具有一个碳原子的基团(不包括CO2),称为一碳基团。一碳基团的转移除了和许多氨基酸的代谢直接有关外,还参与嘌呤和胸腺嘧啶的生物合成 一碳基团转移酶的辅酶:FH4 一碳基团四氢叶酸化合物的结构和命名 -CH=NH 亚氨甲基 H-CO- 甲酰基 -CH2OH 甲醇基 -CH= 次甲基 -CH2- 亚甲基 -CH3 甲基 叶酸 四氢叶酸 H H 10 5 N5,N10-CH2-FH4 N5-CHO-FH4 CH2 CHO * * 核酸酶 核苷酸酶 核酸 核苷酸 核苷 碱基+戊糖-1-磷酸 核苷酸磷酸化酶 1、分类 (1)根据对底物的专一性分: (2)根据切割位点分: 核糖核酸酶(RNase) 脱氧核糖核酸酶(DNase) 非特异性核酸酶 核酸内切酶 核酸外切酶 5′ p p p p OH B p p p p 3′ B B B B B B B 牛脾磷酸二酯酶 ( 5′端外切,切5’端得3’磷酸) 蛇毒磷酸二酯酶 ( 3′端外切,切5’端得3’磷酸) 2、核酸酶的作用特点 5′ p p p p OH Py Pu Py Py 1′ p p p G A C U p p p G A 3′ RNAase I RNAase I RNAase T1 RNAase T1 Pu :嘌呤 Py:嘧啶 原核生物中存在着一类能识别外源DNA双螺旋中4-8个碱基对所组成的特异的具有二重旋转对称性的回文序列,并在此序列的某位点水解DNA双螺旋链,产生粘性末端或平末端,这类酶称为限制性内切酶(ristriction endonuclease)。 限制性内切酶是分析染色体结构、制作DNA限制图谱、进行DNA序列测定和基因分离、基因体外重组等研究中不可缺少的工具,是一把天赐的神刀,用来解剖纤细的DNA分子。 酶 辨认的序列和切口 说明 ‥ ‥A G C T ‥‥ ‥ ‥T C G A ‥ ‥ ‥ ‥G G A T C C ‥‥ ‥ ‥C C T A G G ‥‥ ‥ ‥A G A T C T ‥‥ ‥ ‥T C T A G A ‥‥ ‥ ‥G A A T T C ‥‥ ‥ ‥C T T A A G ‥‥ ‥ ‥A A G C T T‥‥ ‥ ‥T T C G A A ‥‥ ‥ ‥G T C G A C ‥‥ ‥ ‥C A G C T G ‥‥ BamH I Alu I Bgl I EcoR I Hind Ⅲ Sal I 四核苷酸,平端切口 六核苷酸,粘端切口 六核苷酸,粘端切口 六核苷酸,粘端切口 六核苷酸,粘端切口 六核苷酸,粘端切口 I型:分子量大于105,多亚基,需S-线苷蛋氨酸、ATP和Mg2+ ,识别位点与切割位点相差甚远,产物为异质,是限制与修饰相排斥的多功能酶. Ⅱ型:分子量小于105,需Mg2+ ,切割位点位于识别 位点上,产物为专一性片段,不具修饰酶功能。现在分子生物学研究所用的限制性内切酶均为此类。 Ⅲ型:识别位点为5-7 bp的非对称序列 ,切割位点在顺序之外离识别 序列5-10 bp,切割双链,个别也切割单链。是限制与修饰兼有的多功能酶. EcoR I 序号 属名 种名 株名 例:Eco R I,从大肠杆菌(E. coli)R菌珠中分离得到的 第二节 核苷酸的降解 核酸酶
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