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物化生物学
物化生物學
生物體系之電子轉移
醫學二A
B9402001 簡偉哲
B9402015 溫喆夫
B9402016 楊緯聖
B9402020 黃哲緯
B9402021 黃柏翰
B9402040 許瑜真
前言
在生物體的合成反應中,光合作用是最普遍的一個反應,植物利用光能進行一連串的電子轉移作用進而得到可利用的形式-ATP。而電子要在不同的化合物中進行轉移,則需透過配位化合物的幫助,以下將介紹其轉移的機制。
理論簡介
光合作用機制
1.簡要過程
光合作用發生在葉綠體,光能會被葉綠素a分子捕捉,進而激發葉綠素a分子的電子,使之經過一連串的電子傳遞鍊,最後將NADP+還原為NADPH。NADPH會成為暗反應的輔酶,經過卡氏循環後,製造出葡萄糖並且放出二氧化碳。
2.光反應之電子傳遞
光能被光系統II的反應中心p680接收後,會成為激發態並且釋放電子給pheophytin,然後分解水並放出氧氣以補充其電子。電子很快的又由pheophytin傳給位在QA的plastoquinone,再傳給位在QB的plastoquinone。Plastoquinone被還原後會成為plastoquinol,一個強還原劑。
接著光系統I的反應中心p700也接收光能成為激發態,當它釋放電子給位在A0的chlorophyll後,失去的電子會由被plastoquinol還原的plastocyanin補充。接著電子自chlorophyll傳給位在A1的quinone,再經過Fe-S複合體,傳到ferredoxin。接著會有一酵素將ferredoxin的電子傳給NADP+,使其還原為NADPH。
而電子在生物體中的轉移主要是由配位化合物的幫助進行的,因此要了解轉移的機制前我們必須先了解什麼是配位化合物。
配位化合物
配位化合物主要是由中心金屬(complex ion)以及配位基(ligand)所組合而成,其中complex ion是由具有空的D軌域的過渡元素組成,而Ligand是具有lone pair或是π bond的分子,當2者靠近時complex ion提供空軌域,而Ligand則是提供lone pair 或是π bond使2者形成配位共價鍵,因此complex ion可視為路易士酸而Ligand可視為路易士鹼。配位化合物又可分為兩種,傳統配位化合物的Ligand是由lone pair形成配位鍵,而有機金屬配位化合物則是Ligand由π bond與complex ion形成配位鍵。
配位化合物的特性
中心原子的電子雲排列有五種,dz2、dx2-y2、dxy、dxz、dyz,當配位基由六個方位形成鍵結時,原本的能階則會分裂成2個不同大小的能階,一個是能量較大的eg(dz2、dx2-y2)另一個是能量較小的t2g(dxy、dxz、dyz),不同的Ligand會使eg及t2g的能階差不同,親合力大的會使能階差較大形成strong field(low spin),而親合力小的會使能階差較小形成weak field(low spin)。顏色:當一束白光透過配位化合物時,若某一頻率的光剛好為eg及t2g的能階差則此光會使eg上的電子躍遷至t2g上,使得看到的光剛好為其互補光。
順磁性:半滿軌域愈多,順磁性愈大。因此在weak field的情況下,電子填完半滿的t2g軌域時,因為其eg及t2g的能階差異不大,因此會繼續向上填eg至半滿後再回填t2g,而strong filed的情況下,其eg及t2g的能階差異較大,當填t2g至半滿時,無法填至eg因此會將t2g填滿才會填至eg,因此在weak field的情況下,順磁性的可能較大。
而配位化合物進行電子傳遞的方法主要是由於complex ion以及ligand 有著不同的電子親合力大小,進而使得電子進行轉移。而在了解配位化合物後,我們先來介紹電子轉移這個現象,又可分為哪兩個部分探討。
Inner sphere outer sphere
討論電子傳遞首先就是要先介紹inner sphere和outer sphere的現象,outer sphere是因為反應物之間彼此電子的作用力很小,電子可以藉由隧穿效應由donor直接轉移至acceptor,inner sphere反應物之間電子的作用力較大,必須藉由ligand作為架橋來讓電子轉移。
隧穿效應就是因為溶劑分子的重排,使得不同能階電子的能量可以變成一樣,outer sphere是一開始反應物之間靠在某個特定的距離,之後溶劑分子會排成特定的方向,使得donor的電子因為和acceptor上的電子能階一樣而可以直接的轉移,反應完之後兩個離子再離開各自
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