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植物基因工程考试总结
1、名词解释部分
GFP:绿色荧光蛋白,利用绿色荧光蛋白独特的发光机制,可将GFP作为蛋白质标签。
SiRNA:是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。
MAR或SAR:指被限制性内切酶消化后仍与核骨架结合的DNA序列,位于染色体的端粒附近,长度一般为30bp-1000bp,通常富含AT,两个MAR之间的染色质区域可形成大小为5kb-200kb的DNA环,构成独立的表达结构。MAR通过对染色质结构的直接限制而起作用,使转基因不能形成稳定的凝聚染色质结构,保证了转录的正常进行,使RNA酶聚合酶容易接近这种结构,从而提高了转基因的表达效率。
BIBAC:双元细菌人工染色体,使大片段外源DNA稳定整合到宿主细胞基因组中。
LHCP a/b or Cab:光诱导型启动子,在叶中具有叶绿体依赖的光诱导增强特性,在根中具有组织特异的沉默子功能.
RNA interference (RNAi):RNA干扰,与靶基因同源的双链RNA诱导的特异转录后基因沉默现象,使用RNAi技术可以特异性剔除或关闭特定基因的表达。
Dicer酶:是RNA酶Ⅲ家族的一个成员。Dicer酶参与RNAi反应,广泛存在于蠕虫,果蝇,真菌,植物及哺乳动物。
RdRP:RNA合成的聚合酶,在RdRP的作用下,进入细胞内的双链RNA通过类似于PCR的反应过程,呈指数级的数量扩增。
CAT:氯霉素乙酰转移酶基因,一种报告基因,是第1个用于检测细胞内转录活性的报告基因。
IPCR:反向PCR,它的目的在于扩增一段已知序列旁侧的DNA。反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,因此又可称为染色体缓移或染色体步移。
RDA:
RT-PCR:逆转录PCR,是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。
GUS:β-葡萄糖苷酸酶基因,其反应产物可用多种方法检测出来。因此这个基因被广泛应用于基因调控的研究中。
SSH:抑制性消减杂交,是一种鉴定、分离组织细胞中选择性表达基因的技术,其原理是以抑制性多聚酶链反应(PCR)反应为基础的cDNA 消减杂交技术。
DDRT:传统mRNA差异显示技术,根据绝大多数真核细胞mRNA 3端具有的多聚腺苷酸尾(polyA)结构,因此可用含dT的寡聚核苷酸为引物将不同的mRNA反转录成cDNA。将差别表达条带中的DNA回收,扩增至所需含量,进行Southernblot或Northernblot或直接测序,从而对差异条带鉴定分析,以便最终获得差异表达的目的基因。
RAD:代表性差示分析,充分发挥了PCR以指数形式扩增双链模板,而以线性形式扩增单链模板的特性,通过消减和富集,使得目的基因片段得到特异性扩增。
RdRP:RNA为模板指导RNA合成的聚合酶,在RdRP 的作用下,进入细胞内的双链RNA通过类似于PCR的反应过程,呈指数级的数量扩增。
T-DNA标签:以T-DNA为标签,通过农杆菌转化植物,构建突变库,获得大量具表型的突变体,根据插入片段和插入点的基因组序列和突变性状进行分离检测。是一种高通量的分离和克隆植物功能基因的方法。
NPTⅡ:编码新霉素磷酸转移酶,能赋予细胞抗卡那霉素的能力,这是核基因转化中常用的一种筛选标记。
2、简答部分
1)筛选标记基因与报告基因的比较:
筛选标记基因(Selective Marker genes):它的基因产物能给予植物细胞产生一种抗选择压力,在选择剂存在时,转化细胞生长、发育、分化基本不受影响,而没有转化的细胞不能正常生长。
报告基因(reporter genes):是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,其表达产物非常容易被鉴定。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相融合,在调控序列控制下进行表达,从而利用它的表达产物来标定目的基因的表达调控,筛选得到转化体。它的基因产物能使植物细胞带上一种标记,起报告和识别作用。
报告基因,必须具备几个条件:
(1)已被克隆和全序列已测定;
(2)表达产物在受体细胞中不存在,即无背景,在被转染的细胞中无相似的内源性表达产物;
(3)其表达产物能进行定量测定。
2)一元载体和二元载体系统的比较:
双元载体(binary vecter)系统是指由两个分别含TDNA和Vir区的相容性突变Ti质粒构成的双质粒系统,又因为其T-DNA与Vir基因在两个独立的质粒上,通过反式激活T-DNA转移,故称之为反式载体(trans vecter).
一元载体系统由两个质粒重组而成,分子量大,需要整合;二元载体不需要
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