[理化生]化学软件 ChemOffice.ppt

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[理化生]化学软件 ChemOffice

化学与化学工程学院 泰山医学院 化学与化学工程学院 化学软件ChemOffice 概述 化学结构绘图软件CHEMDRAW 分子模型及仿真软件CHEM3D 化学信息有哪些信誉好的足球投注网站引擎CHEMFINDER 1概述 ChemOffice软件是由剑桥化学软件公司开发的集成化学软件桌面系统,集成了Chem3D、ChemDraw、ChemFinder和ChemInfo,以及Chem TableEditor等软件,具有强大的高端开发功能。 2 化学结构绘图软件ChemDraw ChemDraw 软件功能十分强大,可以编辑、绘制与化学有关的一切图形,如建立和编辑各类分子式、方程式、结构式、立体图形、对称图形、轨道等,并能对图形进行编辑、翻转、旋转、缩放、存储、复制、粘贴等多种操作。用它绘制的图形可以直接复制粘贴到Word 软件中使用。必威体育精装版版本的软件还可以生成分子模型、建立和管理化学信息库、增加了光谱化学工具等功能。 2.1主界面 文件命令对话框  图 4-5主工具图标板  2.2模板 2.3绘制与编辑典型化学物质结构式 ① 键的产生: 点位后,向某个方向拖动可以产生。 直接单击,产生所选择类型的化学键,连续点击两键相连默认角度为120度。 点位位于一键的起点(显示小蓝块),沿键拖动会产生重键。 点位为于键中间,单击同样可以产生重键(三键点击后变单键)。 ③ 键及元素文本属性的设置: (2)环工具:主工具面板中提供了10种环工具命令,其中在模板命令中还有芳香化合物模板和双环模板可以绘制环状化合物。 (3)链工具 ① 链的绘制 (4) 使用模板建立3D模型 改变元素序号: 3.3ChemDraw结构式与3D模型的转换 (1)ChemDraw结构式转换为3D模型 3.4Chem3D的计算功能 (1)整理结构和简单优化 (2)分子体积的计算 计算内旋转势能 计算Huckel分子轨道 (4)MOPAC量子力学计算 4化学信息有哪些信誉好的足球投注网站引擎ChemFinder ChemFinder 是一个智能型的快速化学搜寻引擎,所提供的ChemInfo 是目前世界上最丰富的数据库之一,包含ChemACX、ChemINDEX、ChemRXN、ChemMSDX等,并不断有新的数据库加入。该程序可以从本机、网络、服务器中有哪些信誉好的足球投注网站Word、ChemDraw、ISIS、Excel等格式的分子结构文件。ChemFinder 自带多个数据库,其数据库文件扩展名为“sfw”,这些数据库默认存放在C:\Program Files\CambridgeSoft\ChemOffice 2004\ChemFinder\Samples文件下。 4.1化学物质检索方法 4.2 化学反应的检索 4.3查找免费网络资源 2.6绘制实验装置 利用实验仪器模板工具1和实验仪器模板工具2进行实验装置的绘制,在模板中选择所需的实验仪器,单击产生相应的玻璃仪器。玻璃仪器连接处为阴影。通过旋转选择框改变角度和大小进行玻璃仪器的连接。示范图例见下图4-24。 3分子模型及仿真软件Chem3D 3.1 主界面 3.2 3D模型绘制与编辑 (1)利用键工具建立模型 (2)利用文本工具建立模型 图 4-26胡萝卜素立体分子模型 (3)利用子结构建立3D模型 子结构模型库 利用模板建立富勒烯 3D模型 改变元素: 首先选中模型。执行“Edit”菜单中的“Select All”命令或ctrl + A快捷键; 然后整理结构,执行“Tools”菜单中的“Clean Up Structure”菜单命令。 使用垂直工具栏中 的工具,双击需要改变序号的原子,弹出输入框, 输入原子序号,按回车键完成原子序号的更改。 双击需要改变元素符号的原子,弹出输入框,输入元素符号,按回车 键完成原子序号的更改。若原子的三维结构中显示孤对电子,执行关闭 “Tools”菜单中的“Show H’s ans Lp’s”命令,可不显示氢原子和孤对电子。 (5)改变元素序号与替换元素 (2)直接打开ChemDraw文件 (3)3D模型转换为平面结构式 结构优化对话框 4-30 执行“View”命令建立3D分子模型 分子大小的观察 计算分子体积 4-31分子体积计算对话框 4-33内旋转势能计算 4-35HOMO轨道对话框 图 4-36栅格设置对话框 图 4-37乙烯的LUMO分子轨道图 4-38 PM3方法结构优化图 图

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