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关于PET-28a载体的表达
用PET-28a载体的原核表达出来的蛋白一般会是出现在上清呢,还是会出现沉淀中啊?这个载体表达出来的一般是不是包涵体?
用pet-28a载体的原核表达出来的蛋白在破菌前肯定会出现在菌体沉淀中,不会分泌在培养基上清中的。至于破菌以后,表达出来的在沉淀中还是在上清中,要由目标蛋白的性质来定了,没有固定形式的。至于是否是包涵体,主要也是由目的蛋白的性质与表达量来决定的,pet-28a这种载体没有本身溶解性高的多肽融合蛋白,也没有催化二硫键形成的酶融合蛋白,而且不含信号肽序列,所以同一种蛋白用这个载体,形成包涵体的可能性更大些。
楼主是的是大肠杆菌作为外源基因表达的宿主吗?相对其他生物细胞而言,大肠杆菌的蛋白分泌机制并不健全。外源生物基因,特别是外源真核生物基因很难在大肠杆菌中进行分泌型表达,少数的外源基因即便能分泌表达,其表达率通常也比包涵体方式低得多。蛋白产物N端信号肽序列是蛋白质分泌的前提条件,如果楼主用pet-28a载体表达的外源基因的5端不带有信号肽序列的话,将如eastrocket战友所言,表达出来的蛋白在破菌前肯定会出现在菌体沉淀中,但异源蛋白在原核细胞中的定位可能会有两种情况,可能是以可溶性存在或不可溶性(包涵体)存在于细胞质中,这主要取决于的异源蛋白的性质和表达量。
概念
pEGFP-N3载体为真核细胞表达载体。
pEGFP-N3载体特点
①从结构上看,该质粒具有很强的复制能力,可以满足随宿主细胞分裂时跟随胞质遗传给新生的子细胞,这是保证目的基因稳定表达的因素之一;
②含有高效的功能强大的启动子SV40和PCMV,可以使目的基因在增殖的细胞中稳定表达;
③具有多克隆位点,便于目的基因的插入;
④该载体具有neo基因,可以采用G418来筛选已成功转染了该载体的靶细胞。
这些特殊的结构可以实现目的基因在靶细胞内的稳定表达。
pEGFP-N3载体上携带有EGFP蛋白表达基因,如上图质粒图谱所示。
GFP的相关知识
绿色荧光蛋白(Green Fluorescent Protein,GFP)基因来源于Jellyfish Aequorea Victoria, 是Shimomura等于1962年发现的蛋白质,由238个氨基酸组成,分子量约为27Kd。GFPGFP在包括热、极端PH和化学变性剂等苛刻条件下都很稳定,用甲醛固定后会持续发出荧光,但在还原环境下荧光会很快熄灭。
与以往常用的报告基因相比,GFP具有以下优点:
①在荧光显微镜下,用波长约490 nm的紫外线激发后,即可观察到绿色荧光,直接、简捷、便于检测;
②无需任何的作用底物或共作用物,检测的灵敏度不受反应效率的影响,保证了极高的检出率;
③蛋白本身性质稳定;
④可在多种异源生物中表达且无细胞毒性;
⑤其基因片段长度较小(约717 bp),易于构建融合蛋白,且融合蛋白仍能保持荧光激发活性,为研究其他基因表达产物的分布提供了方便。
EGFP是一种优化的突变型GFP,使其产生的荧光较普通GFP强35倍,大大增强了其报告基因的敏感度。EGFP与其他蛋白的融合表达已有很多成功的例子,而且其N及C端均可融合,并不影响其发光。
NotⅠ
限制性内切酶,由豚鼠耳炎诺卡氏菌产生。
识别位点是:GCGGCCGC
切割后的片段具有黏性
它属于 限制性内切酶Ⅱ类。
BamHⅠ
限制性内切酶,由淀粉芽孢杆菌产生。
识别位点是:GGATCC
切割后的片段具有黏性
它属于限制性内切酶Ⅱ类。
报告基因
报告基因 (reporter gene)是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相融合,在调控序列控制下进行表达,从而利用它的表达产物来标定目的基因的表达调控,筛选得到转化体。
重组质粒
基本简介
质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆较小的DNA片段(<10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。在质粒载体上进行克隆,从原理上说是很简单的,先用限制性内切酶切割质粒DNA和目的DNA片段, 然后体外使两者相连接, 再用所得到重组质粒转化细菌,即可完成。但在实际工作中, 如何区分插入有外源DNA的重组质粒和无插入而自身环化的载体分子是较为困难的。通过调整连接反应中外源DNA片段和载体DNA的浓度比例,可以将载体的自身环化限制在一定程度之下,也可以进一步采取一些特殊的克隆策略,如载体去磷酸化等来最大限度的降低载体的自身环化,还可以利用遗传学手段如α互补现象等来鉴别重组子和非重组子。
反应策略
带有非互补突出
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