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植物叶片DNA抽提法
植物叶片DNA抽提法
A.准备的试剂和材料:
液氮
抽提缓冲液:500mM NaCl, 100mM Tris-HCl pH 8.0, 50Mm EDTA pH 8.0, 10mM 巯基乙 醇(使用前加入)
上述溶液均以浓缩液的形式配置保存,使用前混合;配置100ml抽提缓冲液的配方为:
5 M NaCl 10ml
1M Tris-HCl pH 8.0 10ml
0.5 M EDTA 10ml
巯基乙醇 70ul
无菌水 70ml
需配制的溶液:20% SDS, 5M KAc(醋酸钾),3M NaAc(醋酸钠), RNase A(200U/ml), 50 TE
RNase A储存液的配置方法:取25mg的RNase A,在25ml的缓冲液中(1M Tris-HCl 250 ul, 5M NaCl 75 ul, ddH2O 25 ml)溶解—100度煮沸15分钟—缓慢冷却至室温—分装为100ul/管,-20度冻存。
50TE配方: 50 mM Tris-HCl, 10 mM EDTA pH 8.0, (在93ml的无菌水中加入1M Tris-HCl 5ml, 0.5 M EDTA 2ml)
其他材料及设备:
碾钵,灭菌的擦镜纸(事先剪成小块),保温杯(盛液氮),水浴锅(37℃、65℃),台式冷冻高速离心机(1.5--2.0ml),1.5ml离心管(每个样品精细提取需要3支,粗提需要2支),冰盒,异丙醇,无水乙醇(或新近配制的70%乙醇)
B 实验步骤(前面的数据为小量提取法,括号里的斜体划线数据是大量提取法)
a): 打开水浴锅,调整温度到65℃,并将20%SDS放在里面预热;
b):准备好要用的各种溶液,液氮,擦镜纸,适量的碾钵,离心管架,大冰盒(装满冰),1.5ml 离心管。
c):在离心管和碾钵上编号。
取0.5-0.8克幼嫩的叶子(2克)在碾钵中,倒入液氮快速碾磨成细粉――加入750ul /(7.5ml)抽提液到碾钵中继续碾磨几下,将匀浆液倒入相同编号的1.5ml / (50ml) 离心管中。加入50ul /(0.5ml)预热的20%SDS溶液,上下颠倒混匀数次。
注:样品碾磨要充分,快速,并在低温条件下进行;越新鲜,越嫩的组织越好;SDS要及时加入样品缓冲液
65℃水浴10分钟(中间上下混匀几次);零下20度预冷5M KAc。
注:时间不能超过,否则样品会被严重氧化。
取出样品,加入250ul /(2.5ml) 预冷的5M KAc,在冰盒中冰浴20-30分钟。13000转离心15分钟(在此期间准备一套1.5ml /(50ml)离心管,编号,将擦镜纸象叠滤纸的方法一样叠好放在上面);预冷异丙醇。
用枪吸取上清(约900ul),过滤到相应编号的新管子中。加入570ul/ (5ml)预冷的异丙醇,轻轻颠倒混匀,于零下20度静置40分钟以沉淀核酸(或者过中午,过夜都可以)。
注:用擦镜纸过滤可以更好的去除色素和杂质,异丙醇一定要在零下20度预冷。
13000转离心15分钟,去上清,晾干或者用冷冻干燥机抽干(约2分钟)。
注:这里的沉淀不能太干,否则会影响50TE的再溶解;如果沉淀难以溶解,可以用65度助溶10分钟。
加入300ul /(700ul)的50 TE将沉淀溶解,再加入3ul /(7ul)RNase A,于37度水浴1小时来去除RNA。
注:这里也可以用4度过夜处理。而且可以先将50TE和RNase A配成混合液再分别加入每个管子中,这样做可以减轻工作量。
在离心管中加入35 ul /(75ul) 3M NaAc轻弹混匀, 静置5分钟,13000转离心15分钟――取上清(沉淀不溶性杂质)。
在上清中加入200ul/(500ul)异丙醇,轻轻混匀,室温放置5分钟后13000转离心15分钟来沉淀DNA。
注:如果发现DNA不能沉淀下来,请考虑异丙醇的质量是否有问题
去上清,在沉淀中加入预冷的70%无水乙醇轻洗沉淀,13000转离心3-5分钟,小心去上清;然后重复上述操作一次。
将洗涤后的沉淀用冷冻干燥机抽干,溶解于30ul 的纯水中;注意在每支DNA管子上注明日期。
取1ul DNA电泳检测,考察所提取的DNA质量和浓度,并吸取一部分的DNA按比例稀释到50ng/ul,冻存于负20度备用。在冻存盒上注明日期、编号的范围,抽提人姓名等字样。
注:电泳时用DL2000做Marker,每(5 ul)一条电泳带为50ng。
总结:这个方法是精细提取叶片总DNA的方法,提取的DNA在低温条件下可以低温保存半年以上。
粗提植物DNA
(样品仅能存放三天,可以用来做PCR检测)
取样品,与液氮中碾磨
在碾钵中加入750ul抽提缓冲液
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