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SiRNA实验敲除内源性E3连接酶
SiRNA 实验敲除内源性E3 连接酶
1. 材料
·孵箱(37℃,5%,10% CO )
2
·含0.05%胰蛋白酶(trypsin )的EDTA
·培养液(DMEM+10%FBS ,DMEM+30%FBS ,不含 penicillin
/streptomycin )
·减血清培养基(OPTI-MEM )
·转染试剂(Oligofectamine reagent )
·siRNA 寡核苷酸序列
·不含RNA 酶1.5 ml EP 安全锁管
·Hela 细胞,U2OS 细胞
·P60 组织培养皿
·15 ml 聚丙烯锥形管
·50 ml 聚丙烯锥形管
·1×PBS (灭菌)
·EBC buffer (50 mM Tris, pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5% NP40)
·完全 MINI 蛋白酶体抑制剂混合片剂
·ECL 检测试剂
·3×蛋白染料缓冲液(6.7% SDS, 33.3%甘油, 300 mM DTT,溴酚蓝
直至变为橙色)
·蛋白定量试剂
·BSA 稀释至1 mg/ml
·分光光度计
·PVDF 膜
·HRP 连接的抗体
2. 操作流程
注:下述方法为 P60 组织培养皿的操作流程,若使用6 孔板,则用
量减半。
1. 转染前一天,胰酶消化细胞并在无抗生素DMEM+10% FBS培
养液中混悬细胞。特别注意无抗生素培养液能够增强转染效率。
细胞生长达到20-25%的融合度时进行转染。例如1:00 PM接种
5 5
2.2×10 HeLa 细胞3.0 ×10 U2OS细胞,约次日9-10:00 AM
可达到此密度。
2. 转染前37℃水浴预热OPTI-MEM 培养液,转染时培养液置于
室温。
3. 各样品准备一只1.5ml 微量离心管(灭菌,除RNA 酶,只能在
组织培养箱中打开),另备一只主混合管。
4. 各样品管加入356μl OPTI-MEM 和14μl oligo,轻轻涡旋混匀。
5. 各样主混合管加入22μl 预热的 OPTI-MEM 和8μl 转染试剂。
6. 混合物置于室温10min。同时,标记各个将被转染的培养皿。
7. 取出主混合管30μl 混合物加入各样品管。勿涡旋。轻轻翻转混
合几分钟。
8. 室温孵育25min 。同时,以1 ml OPTI-MEM 清洗培养皿一次除
去血清。各60mm 培养皿加入1.6 ml OPTI-MEM。
9. 将转染混合物 400μl 滴加至各标记的培养皿。立即上下左右各
侧晃动培养皿进行混合。
10. 在37℃,10% CO 孵育4-5 h (根据起初融合度,密度较大,
2
则转染时间延长)。
11. 加入1 ml (37℃水浴)预热的30%FBS DMEM至各培养皿。
恢复至5% CO2 。
12. 48h 后收集细胞。含完全MINI 蛋白酶体抑制剂(1 tablet/10 ml
EBC buffer)的EBC buffer 裂解细胞,进行Western blot 分析。
如 HeLa 细胞, 用160-180 μl EBC + PI buffer (85-100%融合
度). 如 U2OS 细胞, 用 140-160 μl. 在冷室(4 ℃)震荡裂解
物 20 min, 4 ℃ 14,000 rpm 离心10 min。将上清液转入1.5-ml
Ep 管中。
13. 测定裂解产物蛋白浓度,并储存于-80℃。
14. Western blot:加样于10% SDSmini-gels,120-130 V
电泳 1-1.5 h 。在冰上用 Bio-Rad 转膜仪将分离的蛋白转至
PVDF 膜,100 V,2 h 。含5% 奶粉的TBST 封闭30-45 min 。
一抗冷室孵育过夜。TBST buffer 洗膜4 次(每次10-15 min),
HRP 连接的抗体(TBST 溶解,含5% 奶粉)室温孵育
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