[生物学]表达谱芯片在医学中的应用.ppt

* 2004年8月3 1日Affymetrix公司宣布其仪器（生产基地位于贝德福德）和芯片（生产基地位于萨克拉曼多）均通过了美国TUV审查，获得了ISO认证，这标志着Affymetrix产品的生产、操作、运输及服务均达到了ISO标准 Affymetrix公司分子诊断市场部副总裁Rob Lipshutz说：“我们一直致力将Affymetrix这一卓越的芯片产品用于临床诊断并为此骄傲，而ISO认证正是对我们努力的认可。” * 2004年9月1日，加州，圣 克来拉－ 今天，Affymetrix公司宣布其GeneChip(R) System 3000Dx系统获得欧盟CE认证，成为世界上第一套被批准用于临床诊断的基因芯片系统，这意味着欧洲实验室可以利用Affymetrix技术平台开展芯片诊断，比如Affymetrix公司与其合作伙伴Roche公司联合推出的Roche AmpliChip(TM) CYP450芯片可用于检测对药物反应至关重要的CYP450基因变异情况。 * FDA的这项决议是Affymetrix涉足临床诊断产品的又一个里程碑。FDA对Affymetrix GeneChip? System 3000Dx的认可是在八月获得ISO认证证书和9月在欧盟通过IVD CE之后。这是FDA审核通过的第一个用于IVD的芯片设备，并因此为核酸诊断提供了一个标准化平台 。 * Microarrays can interrogate genetic aberrations of cancer at the genetic and RNA level. 这是一项着眼于基因组学的技术，可以高通量的一次得到全基因组，全转录组的信息。单核苷酸多态性、特定时间空间的表达谱，不同剪切子的拼接，所有可能产生的转录本，Afffy芯片都已经有相应的产品。 DNA 水平--可将事先选择好的遗传标记SNP的检测探针固定在芯片上，进行高通量的SNP检测，目前可达到一次性检测人类1万/5万/10万个SNP的检测。另可根据实验需求灵活定制SNP芯片。 基于杂交测序原理，使用affy芯片还可以进行特定序列的测定，这是affy的一项相当成熟的技术，早年的HIV突变株检测芯片，p53突变检测芯片，CYP450检测芯片，线粒体测序芯片都是基于杂交测序的原理，在一张芯片，一次实验中即可得到突变检测结果。 RNA水平—从最早的使用全基因组对各种模式生物在各种生理病理状态下的mRNA水平的检测，人们已经摸索并逐渐成熟了表达谱在临床及诊断中的应用：即对各种亚型的肿瘤进行分类，通过表达谱来预测预后。前者已有100余篇文献发表，后者已有成功的对白血病人进行预后的文献发表在新英格兰杂志上。 * This is the last slide in the Expression product section. Let me take a couple of minutes to put the Affymetrix system into a perspective that invites you to take advantage of our expertise in the entire process of analyses, beginning with your genome and ending with results. We have spent a lot of time and effort to develop and optimize all aspects of the system. When you buy an array from Affymetrix, you are not just buying an “array.” You are buying: Genome to Sequence: Highlight neomorphic Array Manufacturing: Scalable, QC tested arrays Assay: Assays are developed, optimized, and validated for our system; all protocols are online Instruments: Highlight the specific system for GeneChip arrays that is fully supported in the field in U.S., Europe, and Asia/Pacific Software: GeneChip specific software to analyze the raw data i