大白菜eIFiso4Ea假基因突变体的鉴别及相关检测.pdf

中国农学通报 2014,30(4): 101-107 Chinese Agricultural Science Bulletin 大白菜eIF(iso)4E.a 假基因突变体的鉴别及 相关检测标记的开发 刘栓桃，张志刚，李巧云，王淑芬，卢金东，张晓燕， 徐文玲，刘贤娴，付卫民，赵智中 （山东省农业科学院蔬菜研究所/ 山东省设施蔬菜生物学重点实验室/ 国家蔬菜改良中心山东分中心，济南250100 ） 摘 要：马铃薯Y 病毒在侵染寄主时与eIF4E 或eIF(iso)4E 的相互作用是一种普遍机制。大白菜病毒病 主要病源是TuMV ，TuMV 在侵染大白菜时能同时与eIF4E 和eIF(iso)4E 发生作用，且在大白菜基因组中 上述2 基因各有3 个拷贝。因而鉴定大白菜资源在上述2 个位点的多样性、发现各位点的功能缺失突变 体至关重要。采用同源克隆和Tail-PCR 技术，鉴定了12份大白菜抗/感TuMV 材料中eIF(iso)4E.a 位点 的多样性。结果表明：5 份材料的eIF(iso)4E.a 基因组序列完整，但与已知序列相比均存在显著差异，包 含3 种新的单倍型；7 份材料的eIF(iso)4E.a 缺失了第4 、5 外显子及3端约1 kb 的大片段，是个假基因。 同时开发了鉴别完整基因与假基因的共显性标记。该策略为鉴定大白菜中eIF4E 和eIF(iso)4E 其他位 点的多样性提供了借鉴，开发的相关检测标记可以作为标记辅助选择的工具用于创新抗病毒大白菜新 种质及培育抗病毒大白菜新品种。 关键词：大白菜；真核生物翻译起始因子异构体；突变体；共显性标记 中图分类号：S634.1 文献标志码：A 论文编号：2013-1607 Characterization of Mutation at Locus eIF(iso)4E.a and Development of Related Markers in Chinese Cabbage LiuShuantao,ZhangZhigang,LiQiaoyun,WangShufen,LuJindong,ZhangXiaoyan, XuWenling,LiuXianxian,FuWeimin,ZhaoZhizhong (VegetableInstituteofShandongAcademyofAgriculturalSciences/ShandongKeyLaboratoryforBiologyof GreenhouseVegetables/ShandongBranchofNationalImprovementCenterforVegetables,Jinan250100) Abstract: InteractionbetweenvirusofPotyviridaefamilyandeIF4EandeIF(iso)4Eisacommonmechanism whentheyinfectplant.TuMVof Potyviridae familyisthemostseriousvirusresourceinfectingChinese cabbage.ItcanusebotheIF4EandeIF(iso)4Ewheninfectionandeachgenehasthreecopiesingenomeof Chinese cabbage. Thus it’s necessary to screen the status of each locus among core Chinese cabbage germplasmsresistantorsusceptibletoTuMV.Atpresentstudy,wecharacterizedthreenovelhaplotypesamong five lines possessing intact eIF(iso)4E.a gene;