动物肝脏DNA提取.ppt

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动物肝脏DNA提取

生物制药班 小组成员:李新 张妮 台影 杨晨 石维丽 王欣欣 动物肝脏中DNA的提取 1、掌握动物组织总DNA的提取方法及其原理。 2、掌握琼脂糖凝胶电泳分离核酸的原理和方法。 3、学习核酸染色的方法。 一、实验目的: 二、实验原理: 要获得纯的DNA样品,必须考虑以下几点: 如何选材,如何破碎组织细胞? 如何除去蛋白质?(在真核细胞内,DNA与蛋白质结合成核蛋白的形式存在。因此,分离DNA时必须使其与蛋白质解离,并除去蛋白质。) 设法除去RNA的污染; 防止DNA酶的降解作用; (一)动物肝脏DNA制备原理 基因组DNA的提取方法 浓盐法:利用RNA和DNA在不同盐浓度溶液中的溶解度不同将二者分离。 离子去污剂法:利用SDS、CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)等去污剂是蛋白质变性,直接从生物材料中提取DNA。 苯酚抽提法:苯酚既是蛋白变性剂,又能抑制DNase的降解。用苯酚处理匀浆时,由于蛋白与DNA连接键已断,蛋白分子表面又含有很多极性集团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。 选 材 要提取动物组织DNA,一般选择细胞膜较脆弱,容易破碎的动物脏器,如胸腺、肝脏、脾脏、胰脏等。 除去RNA的方法 脱氧核糖核蛋白在浓NaCl(1-2mol/L)溶液中溶解度很大,但在0.14mol/L NaCl溶液中溶解度很低,而核糖核蛋白则溶于0.14mol/L NaCl溶液中,利用这一性质可将脱氧核糖核蛋白与绝大部分核糖核蛋白分离开来。 除去蛋白质的方法 用氯仿一异成醇混合液振荡核蛋白溶液,使蛋白质变性,然后离心除去变性蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA溶于上层水相。用两倍体积 95%乙醇溶液可将DNA钠盐沉淀出来。 用十二烷基硫酸钠(SDS)等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA。 纯的DNA样品的获得 为了防止DNA酶的降解,提取时可加入适量EDTA(乙二胺四乙酸)、柠檬酸,以降低DNA酶的活性。 加入RNA酶降解剩余的RNA,获得纯的DNA。 保存:将DNA于滤纸上干燥,溶于1mlTE中低温保存。   (二)琼脂糖凝胶电泳分离核酸的原理: 琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖凝胶作为支持介质的一种电泳分离方法,是一种简便、快速分离鉴定核酸的方法,已成为分子生物学及基因工程研究中常用实验方法之一。 琼脂糖英文名agarose,是从琼脂中提取出来的,由半乳糖和3.6-脱水-L- 半乳糖相互结合的链状多糖。琼脂糖和琼脂都可在不同浓度的水溶液下可形成多孔的凝胶,电泳中具有分子筛效应。但琼脂糖含硫酸根比琼脂少,电渗作用降低,因而分离效果明显提高。 荧光来自两方面,一是核酸吸收260nm的紫外光,并将能量传给EB;二是EB本身吸收波长为302nm和360nm的紫外光。这两方面的能量最终激发EB发出波长为590nm的红橙色荧光。 溴化乙啶可加入凝胶中,也可以在电泳后,将凝胶放在含EB的溶液中浸泡. 溴化乙啶检测DNA的灵敏度很高,可检出10ng甚至更少的DNA。 (一)材料:动物肝脏 (二)试剂: (1)0.14mol/LNaCl-0.15mol/L EDTA-Na溶液: (2)20%SDS溶液: (3)氯仿一异戊醇(24:1)混合液: (4)95%乙醇溶液。 (5)80%乙醇溶液。 (6) pH8.0TE缓冲液:10 mmol/LTris-HCI,lmmol/L EDTANa,其中含RNA酶20ug/mL。 二、实验材料、试剂和仪器: (7)电泳缓冲液:Tris-硼酸-EDTA(50×TBE)pH8.0。 (8)加样缓冲液:0.25%溴酚蓝(BPB)40%蔗糖。 (9)溴化乙啶(EB)溶液:10μg/ml。 (10)琼脂糖凝胶:浓度为0.7%。 (三)仪器 (1)稳压稳流电泳仪 (2)可调微量移液器 (3)水平电泳槽 (4)暗箱紫外透射仪等。 三、实验步骤: 1.取新鲜动物肝,称取1g,切成小块,加入2ml 0.14mol/L NaCl-0.15mol/L EDTA溶液,于研钵中研磨至匀浆,再加2ml清洗转入离心管中,以4000r/min的转速离心 10min。 2.在上述沉淀物中加入2mL 0.14mol/L NaCl-0.15mol/L EDTA溶液,然后在60℃下,滴加 20%SDS溶液3-5滴,边加边摇动,再摇动 10min,使核酸与蛋白质分离。 3. 加固体氯化钠0.2g混匀,使其最终浓度达到l.4mol/L,水浴30min。 4.加等体积的氯仿一异戊醇,混匀,摇动5

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