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生物信息学导论Introduction to Bioinformatics;课程安排 1、时间：每周二晚11～12节（19:10~21:00） 教室：一教208教室 学时：每周2学时（总计16?2=32学时） 2、学分：2学分 3、成绩考核方式（无笔试）： 1次调研报告（分2次在课堂讨论），占总成绩50％ 1次学习研究论文（期末完成），占总成绩40％ 其它占总成绩10％ 4、E-mail: hqzhu@ Tel:6276 7261(office) （办公室地址：力学系力学楼503室） 5、课程大纲和讲义可在北大理论生物学中心网站下载。 （/main/Course.htm）;参考资料 Westhead et al., Bioinformatics（英文原版），科学出版社，2003年 Pevzner，Computational Molecular Biology，MIT Press，2000 Salzberg, et al., Computational Methods in Molecular Biology, Elsevier Science, 1998 Waterman, Introduction to Computational Biology, Chapman Hall, 1995 Durbin等, Biological sequence analysis（英文原版）, 清华大学出版社，2002 Brown著，袁建刚等译，基因组，科学出版社，2002年 Campbell等著，孙之荣等译，探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学，科学出版社，2004年 郝柏林、张淑誉，生物信息学手册（第二版），上海科学技术出版社，2002年 Attwood等著，罗静初等译，生物信息学概论，北京大学出版社，2002年 Mount，Bioinformatics—Sequence and Genome Analysis，科学出版社，2002年（中文版由钟杨等译、高等教育出版社2003年出版）;第一章 前 言; §1.1 从人类基因组计划（HGP）说起 ;曼哈顿原子弹计划 （1942-46）;1961年，美国总统Kennedy提出两个科学计划： ?登月计划 ?攻克肿瘤计划 ? 人类遗传信息的复杂性;生命活动三要素：物质、能量、信息;HGP的最初目标通过国际合作，用15年时间(1990～2005)至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其它生物进行类似研究。 4张图：遗传图 物理图 序列图 基因图 HGP的终极目标 阐明人类基因组全部DNA序列； 识别基因； 建立储存这些信息的数据库； 开发数据分析工具； 研究HGP实施所带来的伦理、法律和社会问题。 ;1995 第一个自由生物体流感嗜血菌(H. inf)的全基因组测序完成 1996 完成人类基因组计划的遗传作图 启动模式生物基因组计划;1997 大肠杆菌(E.coli)全基因组测序完成 1998 完成人类基因组计划的物理作图 开始人类基因组的大规模测序 Celera公司加入，与公共领域竞争 启动水稻基因组计划 1999.7 第5届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度;2000 Celera公司宣布完成果蝇基因组测序 国际公共领域宣布完成第一个植物基因组——拟南芥全基 因组的测序工作 2000.6.26 公共领域和Celera公司同时宣布完成人类基因组工作草图 2001.2.15 《Nature》刊文发表国际公共领域结果 2001.2.16 《Science》刊文发表Celera公司及其合作者结果;2001年2月15日《Nature》封面;At the White House on June 26, Francis Collins (r), Director of the National Human Genome Research Institute, President Clinton, and J. Craig Venter, President of Celara Genomics, lauded the thousands of scientist