[农学]第17章分子标记辅助选择.ppt

第三节 数量性状的标记辅助选择 数量性状的遗传基础 主效基因-微效基因 多个微效基因作用 数量性状的分子标记辅助选择 主效基因的辅助选择 微效基因的辅助选择 全基因组选择 1.主效基因的分子标记选择 性状分解; 性状数据获得; 分子标记定位; 利用近等基因系建立精细定位群体; 精细定位和基因效应验证; 分子标记的验证; 分子标记辅助育种. Pup1 core markers Field evaluation and selection of IR64-Pup1 and IR74-Pup1 breeding lines 3 全基因组选择(Genome-wide selection ) Now it may be feasible to ask how best to use markers to make genetic gains discovery of SNPs and other high density polymorphic markers high throughput genotyping has reduced costs costs for phenotyping continue to increase May be possible to select an array of markers without establishing significant associations with traits Genome resequencing enables genomic selection and marker-assisted selection 参考文献 1.Collard B C Y, Mackill DJ. Marker assisted selection: an approach for precision plant breeding in the twenty-first century. Phil.Trans.R.Soc.B,2007,1-16 2.Bernarardo R. Molecular and selection for complex traits in plants: learning from the last 20 years. Crop Science, 2008,48:1649-1664 讨论 MAS的基本流程和优势？ MAS对哪些性状的选择有效？ 如何提高数量性状的MAS选择效率？ MAS广泛应用于育种实践中存在的问题？ 如何在育种计划中结合MAS？ * no tests for significance of individual markers 数量性状的标记辅助选择意义很大，但困难也很大，目前多局限在理论研究上，实际成功例子很少： （1）只有少数数量性状的全部QTL被精细定位出来，无法对数量性状进行全面的标记辅助选择； （2）育种过程中同时对许多目标QTL进行选择相当困难； （3）上位性效应对选择效果影响很大，常使选择达不到预期目的。 2.微效基因的辅助选择 1）基因型选择：即对每个目标QTL利用其两侧相邻标记或单个紧密连锁的标记进行选择，其原理和方法与质量性状相似。 2）关键问题：The uncertainty of the true target location，i.e. the exact location of the target is often not known. 3）计算TCR值：假定QTL检测已经完成，QTL的期望（最可能）位置已经确定，同时已给出置信区间，而真实的目标是位于期望QTL附近的某一点，遵循一个均值为0、方差为置信区间长度的正态分布。对每一个可能的真实位置都计算TCR值，然后平均 （Hospital and Charcosset，1997）。 4）不完全基因型选择，即对那些已定位的QTL进行基因型选择。在选择目标QTL的同时，同样也可以利用分子标记进行背景选择，加快遗传背景恢复成轮回亲本的速度。 △分子标记在水稻产量遗传改良上的应用 通过分子技术在野生稻中，发现两个增产QTL，每个QTL具有比对照品种增产18%的效应（ Xiao 等，1995） 。已将其中的一个QTL转移到栽培稻中，用这种携带野生稻增产QTL水稻配组的杂交稻，2003年在浏阳作双季晚稻百亩示范，亩产700公斤。 J23A/Q611 Shen et al. (2005) Used BNL1521 and BNL2961 markers f