[建筑]第一章 基因操作原理的理论基础.doc

第一章? 基因操作原理的理论基础 第一节 基因操作原理 ??? 基因操作（Gene Manipulation）的核心部分为分子克隆（molecular cloning）。由于政府对基因操作有一定的法律约束，大多数国家对此都有一个精确的法律定义。比如在英国将基因操作定义为将在细胞外产生的核酸（物质）分子插入到病毒、质粒或其它载体系统中，再整合到那些本来不含该类物质的宿主中，从而形成一种新的可连续繁殖的有机体。（引自 Principles of Gene Manipulation ，Black well Scientific Publications , RW. OLD SB Primrose , 1985）。强调外源核酸分子（一般情况下都是 DNA）在不同宿主中的繁殖，打破自然种的界限，将来自不相关物种的基因放入一个宿主中是基因操作的重要特征。另一个特征是繁殖。????这里所说的基因操作并不是一个法律概念，除了包括基因克隆外，还包括基因的表达、调控、检测和改造等与基因研究相关的内容。 ????本课程就是为了讲述在核酸水平上对基因进行研究所涉及的方法、技术和策略的原理，主要是基本的、通用的原理，对于涉及到具体的学科或领域的原理不在此范围内。????基因操作原理在生物学科发展中具有重要地位。这门课以前叫“分子克隆Ⅰ”，“分子克隆Ⅱ”为实验课。但无论叫什么，本门课程到底要讲些什么，它的地位如何？????20 世纪是生物学发展最为迅速的时期， 1953 年由于认识了 DNA 的双螺旋结构，从而揭开了分子生物学研究的热潮。在整个生物学研究进程或研究层次来说，其发展过程涉及到个体、组织器官、细胞、亚细胞水平，同时由于遗传学的兴起与发展， DNA 作为生命遗传信息的物质基础被确定下来，从而导致分子生物学的诞生。????分子生物学严格来说应是从分子水平或核酸水平上进行研究的生物学，研究生物的生物学现象和本质，如DNA的结构、复制、表达、调控、遗传、变异等。由于分子生物学的进一步发展，生物学的各个分枝学科都延伸到了分子水平，在这种情况下，传统分子生物学就是一个包罗万象的学科，大的可以说动、植、微生物的分子生物学，小的可以说某些物种的分子生物学，如水稻的分子生物学、链霉菌的分子生物学、芽胞杆菌的分子生物学。????在这种情况下，传统的分子生物学就好象是高级生物化学，阐述基因或者说 DNA（核酸）的静态和动态化学本质。目前的分子生物学，朝着发育、结构和遗传生物学的方向发展。如果说传统的分子生物学是静态分子生物学的话，那么这些学科可以说是动态分子生物学，即在分子水平（核酸）上，研究生物的生长、分化、死亡以及遗传和变异的内在规律。????在以上这些研究中，均涉及在 DNA 水平的操作，本门课程就是要讲述这相关的原理，为分子生物学的研究服务。通过分子生物学内在的原理，如 DNA 结构、复制、转录、表达、调控等，讲述研究方法和技术的设计原理。 第二节 基因的结构——理论基础 1．基因及其产物的共线性?????? ?基因决定蛋白质的序列组成，是由密码子对应特定氨基酸所决定的。当一个基因的核苷酸序列与其产物的氨基酸序列是一一对应时，则表明它们是共线性的。例如，由 N 个氨基酸组成的蛋白质，其基因由对应的基因编码区的 3N 个碱基组成。在原核生物中，基因与其产物是共线性的。这在基因克隆中有重要意义。 2．基因及其产物的非共线性????70 年代以来，在真核生物中发现了间断基因（interrupted genes），后来发现这种间断基因在真核生物中普遍存在，也就是后来所说的基因间存在着内含子（intron）。??? 内含子指真核生物基因中不能翻译成蛋白质的 DNA 片段，但可被转录，当两侧序列（外显子）的转录 RNA 被剪接在一起时，就将内含子转录的 RNA 从整个转录物中除去。外显子是指能够翻译成蛋白质的任一间断的基因片段，一个基因可有多个外显子。内含子并不是一成不变的，具有相对性，对一个 DNA 片段来说，在某个基因中是内含子，但在另一个基因中却可作为外显子。图 1-1 是从 DNA 到蛋白质的流程。????实际上内含子与外显子的概念是相对而言的。有些内含子可作为其它基因的外显子，它们是彼此不相关的基因，如 Yeast 线粒体中的某些基因。另外基因本身有可变换的表达途径，在一条途径中作为内含子的片段，在另一途径中可作为外显子。这两条途径产生两种蛋白质，它们的末端是相同的，但其中之一在中央部分有额外的序列，因而这一 DNA 区段可以为一种以上的蛋白质编码。 DNA ??????exon1 intron 1 exon 2 intron 2 exon 3 intron 3 exon 4 ??转录 Pro-mRNA ????????ex