普通荞麦种内丝裂原活化蛋白激酶序列分析-华南农业大学学报.PDF

　华南农业大学学报　２０１６，３７（４）：９０９６ ｈｔｔｐ： ｘｕｅｂａｏ．ｓｃａｕ．ｅｄｕ．ｃｎ ∥ 　　　　　　　　　　 　ＪｏｕｒｎａｌｏｆＳｏｕｔｈＣｈｉｎａＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｄｏｉ：１０．７６７１／ｊ．ｉｓｓｎ．１００１４１１Ｘ．２０１６．０４．０１５　 梁成刚，陈晴晴，石桃雄，等．普通荞麦种内丝裂原活化蛋白激酶序列片段分析［Ｊ］．华南农业大学学报，２０１６，３７（４）：９０９６． 普通荞麦种内丝裂原活化蛋白激酶序列分析 梁成刚，陈晴晴，石桃雄，陈其皎，孟子烨，陈庆富 （贵州师范大学 荞麦产业技术研究中心／贵州省荞麦工程技术研究中心，贵州贵阳５５０００１） 摘要：【目的】比较普通荞麦Ｆａｇｏｐｙｒｕｍｅｓｃｕｌｅｎｔｕｍ种内丝裂原活化蛋白激酶基因（ＭＡＰＫ）序列的差异，研究ＭＡＰＫ 基因序列在普通荞麦栽培进化过程中的变化。【方法】以普通荞麦的９个栽培品种和３个落花落果野生种质为材 料，ＰＣＲ特异性扩增获得ＭＡＰＫ基因的保守片段，对基因片段序列进行差异分析和蛋白结构预测。【结果】荞麦 ＭＡＰＫ基因ｃＤＮＡ全长为２８３５ｂｐ，开放阅读框 １８２７ｂｐ，编码６０９个氨基酸，含有ＴＤＹ的三肽模块，为植物Ｄ组 ＭＡＰＫ蛋白。ＰＣＲ扩增获得１２个供试材料的ＭＡＰＫ序列，其单型不变位点为７２３个，多态位点为７０个。９个栽培 品种间开放阅读框（ＯＲＦ）区域无序列差异，３个野生种质间ＯＲＦ区域也无序列差异。栽培品种与野生品种的ＯＲＦ 区域序列含有８个差异位点，编码３个差异氨基酸。其中，ＯＲＦ区域第１３位点组氨酸（Ｈ） 酪氨酸（Ｙ）发生置换， → 导致１个 －螺旋构象发生变化。【结论】普通荞麦ＭＡＰＫ基因序列高度保守，栽培驯化对ＯＲＦ区域第 １３位点差 α 异氨基酸的选择具有高度一致性。 关键词：普通荞麦；丝裂原活化蛋白激酶；序列分析；氨基酸位点；蛋白结构 中图分类号：Ｓ５１７；Ｓ３２１　　　　　　文献标志码：Ａ　　　　　文章编号：１００１４１１Ｘ（２０１６）０４００９００７ Ｓｅｑｕｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓｏｆｍｉｔｏｇｅｎａｃｔｉｖａｔｅｄｐｒｏｔｅｉｎｋｉｎａｓｅｓｏｆ ｃｏｍｍｏｎｂｕｃｋｗｈｅａｔ ，Ｆａｇｏｐｙｒｕｍｅｓｃｕｌｅｎｔｕｍ ＬＩＡＮＧＣｈｅｎｇｇａｎｇ，ＣＨＥＮＱｉｎｇｑｉｎｇ，ＳＨＩＴａｏｘｉｏｎｇ，ＣＨＥＮＱｉｊｉａｏ，ＭＥＮＧＺｉｙｅ，ＣＨＥＮＱｉｎｇｆｕ （ＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒｏｆＢｕｃｋｗｈｅａｔＩｎｄｕｓｔｒｙＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＧｕｉｚｈｏｕＮｏｒｍａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ／Ｂｕｃｋｗｈｅａｔ ＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒｏｆＧｕｉｚｈｏｕＰｒｏｖｉｎｃｅ，Ｇｕｉｙａｎｇ５５０００１，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：【Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ】Ｔｏｉｄｅｎｔｉｆｙｔｈｅｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｏｆｍｉｔｏｇｅｎａｃｔｉｖａｔｅｄｐｒｏｔｅｉｎｋｉｎａｓｅｇｅｎｅ（ＭＡＰＫ） ｓｅｑｕｅｎｃｅｓａｍｏｎｇｉｎｔｒａｓｐｅｃｉｆｉｃｃｏｍｍｏｎｂｕｃｋｗｈｅａｔ，Ｆａｇｏｐｙｒｕｍｅｓｃｕｌｅｎｔｕｍ，ａｎｄｓｔｕｄｙｔｈｅｓｅｑｕｅｎｃｅ ｃｈａｎｇｅｄｕｒｉｎｇｔｈｅｃｈｒｏｎｉｃａｌｄｏｍｅｓｔｉｃａｔｉｏｎｐｒｏｃｅｓｓ．【Ｍｅｔｈｏｄ】Ｔｈｅｃｏｍｍｏｎｂｕｃｋｗｈｅａｔｖａｒｉｅｔｉｅｓ，ｃｏｎｔａｉ ｎｉｎｇｎｉｎｅｃｕｌｔｉｖａｒｓａｎｄｔｈｒｅｅｗｉｌｄｔｙｐｅｓｗｉｔｈｓｈａｔｔｅｒｉｎｇｈａｂｉｔ，ｗｅｒｅｓｅｌｅｃｔｅｄｆｏｒＰＣＲａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｔｈｅ ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｖｅｆｒａｇｍ