字符串之后缀数组.docx

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字符串之后缀数组

后缀数组——处理字符串的有力工具作者:罗穗骞2009年1月  【摘要】  后缀数组是处理字符串的有力工具。后缀数组是后缀树的一个非常精巧的替代品,它比后缀树容易编程实现,能够实现后缀树的很多功能而时间复杂度也并不逊色,而且它比后缀树所占用的内存空间小很多。可以说,在信息学竞赛中后缀数组比后缀树要更为实用。本文分两部分。第一部分介绍两种构造后缀数组的方法,重点介绍如何用简洁高效的代码实现,并对两种算法进行了比较。第二部分介绍后缀数组在各种类型题目中的具体应用。  【关键字】  字符串,后缀,后缀数组,名次数组,基数排序,  【正文】一、后缀数组的实现  本节主要介绍后缀数组的两种实现方法:倍增算法(Doubling Algorithm)和DC3算法(Difference Cover),并对两种算法进行了比较。可能有的读者会认为这两种算法难以理解,即使理解了也难以用程序实现。本节针对这个问题,在介绍这两种算法的基础上,还给出了简洁高效的代码。其中倍增算法只有25行,DC3算法只有40行。1.1、基本定义  子串:字符串S的子串r[i..j],i≤j,表示r串中从i到j这一段,也就是顺次排列r[i],r[i+1],...,r[j]形成的字符串。  后缀:后缀是指从某个位置i开始到整个串末尾结束的一个特殊子串。字符串r的从第i个字符开始的后缀表示为Suffix(i),也就是Suffix(i)=r[i..len(r)]。  大小比较:关于字符串的大小比较,是指通常所说的“字典顺序”比较,也就是对于两个字符串u、v,令i从1开始顺次比较u[i]和v[i],如果u[i]=v[i]则令i加1,否则若u[i]v[i]则认为uv,u[i]v[i]则认为uv(也就是vu),比较结束。如果ilen(u)或者 ilen(v)仍比较不出结果,那么若len(u)len(v)则认为uv,若len(u)=len(v)则认为u=v,若len(u)len(v)则 uv。  从字符串的大小比较的定义来看,S的两个开头位置不同的后缀 u和v进行比较的结果不可能是相等,因为 u=v的必要条件len(u)=len(v)在这里不可能满足。  后缀数组:后缀数组SA是一个一维数组,它保存1..n的某个排列SA[1],SA[2],……,SA[n],并且保证 Suffix(SA[i])Suffix(SA[i+1]),1≤in。也就是将S的n个后缀从小到大进行排序之后把排好序的后缀的开头位置顺次放入SA中。  名次数组:名次数组Rank[i]保存的是Suffix(i)在所有后缀中从小到大排列的“名次”。  简单的说,后缀数组是“排第几的是谁?”,名次数组是“你排第几?”。容易看出,后缀数组和名次数组为互逆运算。如图1所示。  设字符串的长度为n。为了方便比较大小,可以在字符串后面添加一个字符,这个字符没有在前面的字符中出现过,而且比前面的字符都要小。在求出名次数组后,可以仅用O(1)的时间比较任意两个后缀的大小。在求出后缀数组或名次数组中的其中一个以后,便可以用O(n)的时间求出另外一个。任意两个后缀如果直接比较大小,最多需要比较字符n次,也就是说最迟在比较第n个字符时一定能分出“胜负”。1.2、倍增算法  倍增算法的主要思路是:用倍增的方法对每个字符开始的长度为2k的子字符串进行排序,求出排名,即rank值。k从0开始,每次加1,当2k大于n以后,每个字符开始的长度为2k的子字符串便相当于所有的后缀。并且这些子字符串都一定已经比较出大小,即rank值中没有相同的值,那么此时的rank值就是最后的结果。每一次排序都利用上次长度为2k-1的字符串的rank值,那么长度为2k的字符串就可以用两个长度为2k-1的字符串的排名作为关键字表示,然后进行基数排序,便得出了长度为2k的字符串的rank值。以字符串“aabaaaab”为例,整个过程如图2所示。其中x、y是表示长度为2k的字符串的两个关键字。  具体实现:??? intwa[maxn],wb[maxn],wv[maxn],ws[maxn];??? intcmp(int *r,inta,intb,int l)??? {return r[a]==r[b]r[a+l]==r[b+l];}??? void da(int *r,int *sa,intn,int m)??? {??????? inti,j,p,*x=wa,*y=wb,*t;???????? for(i=0;im;i++) ws[i]=0;???????? for(i=0;in;i++) ws[x[i]=r[i]]++;???????? for(i=1;im;i++) ws[i]+=ws[i-1];???????? for(i=n-1;i=0;i--) sa[--ws[x[i]]

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