分子模拟实验额外文献作业.docx

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2018-06-28 发布于河南
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分子模拟实验额外文献作业.docx

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分子模拟实验额外文献作业

氢键相互作用及过渡态的优化甲酸和水分子形成的络合物的构型优化HCOOH ------------ H2O + CO设计的过渡态如下------------- GAMESS Interface ------------GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) UHF/6-31G(d)Finish @ energy = -166150.964067 Kcal/Mol (-264.778634 Hartrees)------------------------------------------尿素和水形成氢键------------ GAMESS Interface ------------GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) UHF/6-31G(d)Finish @ energy = -188258.689979 Kcal/Mol (-300.009567 Hartrees)------------------------------------------3、3O+2CH2OH平衡键长1.366------------ GAMESS Interface ------------GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) UHF/6-31G(d)Finish @ energy = -118776.493623 Kcal/Mol (-189.282548 Hartrees)------------------------------------------扫描----------- GAMESS Interface ------------GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) UHF/6-31G(d)Finish @ energy = -46927.58803 Kcal/Mol (-74.783934 Hartrees)键长?Energy(Kcal/Mol)1.3-118774.23121.366-118776.4936231.4-118776.02491.5-118770.26231.6-118760.51651.65-118754.88731.68-118751.40251.72-118746.73901.8-118737.98091.88-118731.09723O+2CH2OH-118720.1110------------------------------------------生成醛的过渡态：------------ GAMESS Interface ------------GAMESS Job: Optimize to Transition State UHF/6-31G(d)Finish @ energy = -118742.639222 Kcal/Mol (-189.228597 Hartrees)------------------------------------------过渡态的确定虚频为272.84 I 1 2 3 4 5 FREQUENCY: 272.84 I 208.13 26.24 15.82 13.97 REDUCED MASS: 10.74103 5.35183 8.27579 8.31406 8.05505 IR INTENSITY: 5.18451 0.06758 0.01497 0.01009 0.03495 6 7 8 9 10 FREQUENCY: 57.81 262.92 297.45 520.05 923.21 REDUCED MASS: 6.68774 3.17727 1.02681 4.63662 1.22834 IR INTENSITY: 0.08217 1.03754 2.85461 0.67520 0.01894 11 12 13 14