ncbi数据库检索幻灯片教程.ppt

;2.1 综合性数据库 NCBI; NCBI的任务;2.1.2 NCBI数据库介绍;5 三维结构域数据库;10 SNP数据库;2.1.4 Entrez 检索实例; ; ;;1 Genome数据库查询结果;2核酸数据库查询结果; ; ;4 结构数据库查询结果;5序列的下载;2.2 综合性数据库EMBL- EBI; 2.2.2 EBI数据库简介;2.2.4 SRS 检索实例;SRS系统每次只能查询一个数据库; Genome数据库查询结果; 数据库格式简介; EMBL和GenBank数据库的主要内容和格式 序列名称、长度、日期 序列说明、编号、版本号 物种来源、学名、分类学位置 相关文献作者、题目、刊物、日期 序列特征表 碱基组成 序列（每行60个碱基） GenBank采用GBFF格式 ;描述符;长度;生物分子类型;形状;分类码;数据第一次被公开的日期;简单的描述;检索号;版本号，序列改变，版本加1;Geninfo identifier 基因信息号;序列来源的生物名称;参考文献;作者及参考文献题目;期刊，及发表年份，卷及期、页码;评注;特征表;关键字;BASE COUNT ??A ??C ??G ??T ORIGIN 1 agcttttcat tctgactgca acgggcaata tgtctctgtg tggattaaaa aaagagtgtc 61 tgatagcagc ttctgaactg gttacctgcc gtgagtaaat taaaatttta ttgacttagg 121 tcactaaata ctttaaccaa tataggcata gcgcacagac agataaaaat tacagagtac 181 acaacatcca tgaaacgcat tagcaccacc attaccacca ccatcaccat taccacaggt 241 aacggtgcgg gctgacgcgt acaggaaaca cagaaaaaag cccgcacctg acagtgcggg 301 cttttttttt cgaccaaagg taacgaggta acaaccatgc gagtgttgaa gttcggcggt 361 acatcagtgg caaatgcaga acgttttctg cgtgttgccg atattctgga aagcaatgcc 421 aggcaggggc aggtggccac cgtcctctct gcccccgcca aaatcaccaa ccacctggtg … … 4639021 caacatcaac tgcaagcttt acgcgaacga gccatgacat tgctgacgac tctggcagtg 4639081 gcagatgaca taaaactggt cgactggtta caacaacgcc tggggctttt agagcaacga 4639141 gacacggcaa tgttgcaccg tttgctgcat gatattgaaa aaaatatcac caaataaaaa 4639201 acgccttagt aagtattttt c //;EMBL标识字;ID U00096 standard; circular genomic DNA; CON; 4639221 BP. AC U00096; SV U00096.1 DT 24-JUL-2003 (Rel. 76, Last updated, Version 3) DE Escherichia coli K-12 MG1655 complete genome. KW . OS Escherichia coli K12 OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; OC Enterobacteriaceae; Escherichia; Escherichia coli. RN [1] RP 1-4639221 RX MEDLINE; RX PUBMED; 9278503. RA Blattner F.R., Plunkett G. III, Bloch C.A., Perna N.T., Burland V.,… RT The complete genome sequ