18第十章节分类鉴定.ppt

第十章微生物的分类鉴定 定义：按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群的科学。 任务：分类、鉴定、命名 第一节 细菌分类 一、种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum（或Division）——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species 三、种以下的分类单元 亚种（subspeciers）：种的进一步细分，一般指其某一明显而稳定的特征与模式中不同的种. 型 ：使用中用型作为后缀；表示细菌菌株 菌株（strain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体极其一切后代； 四、微生物的命名 命名：菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认，并通用的名称。 命名原则：双名法 学名=属名+种名+（首次定名人）+定名年份 规定与常识：属名应大写首字母，种的加词代表一个种的次要特征，首字母小写，属名和种名采用斜体字。例如： 金黄色葡萄球菌， Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 Bacillus subtilis (Ehrenberg,1835) Cohn 1872 五、细菌分类和伯杰氏手册 细菌：伯杰氏鉴定细菌学手册（第八、第九版）、细菌系统学手册（第一版） 第二节 微生物的分类系统 一、生物的界级分类学说 是在认识发展过程中存在的对生物分类的不同阶段的不同观点。 如：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三原界系统 二、三原界系统 是1978年由Wose提出的，所有生物存在一个共同祖先，由它分三条进化路线，就形成了三个原界：古细菌原界、真细菌原界、真核生物原界1990年，又改为古生菌、真细菌、真核生物 三、系统发育树定义： 第三节 微生物的分类鉴定方法 菌种鉴定步骤： 获得纯培养物 测定必要的鉴定指标 查找权威性的菌种鉴定手册 二、遗传分类法 1、G+C含量的测定 由于微生物（G+C）mol%具有较稳定的值，可代表其遗传特征。一般而言，亲缘关系密切和表型又高度相似的微生物常有相似的（G+C）mol% 2、DNA杂交。 亲缘关系越近的微生物，其碱基顺序就越近，反之就越远。 3、16s rRNA的核苷酸序列分析 三、氨基酸顺序和蛋白质分析 蛋白质的氨基酸序列直接反映mRNA 的序列，并与编码它们合成的基因结构密切相关。 因此，比较不同微生物的蛋白质可以间接揭示微生物的系统发育关系。 比较蛋白质的方法有多种。其中，最直接的方法是测定具有相同功能的蛋白质的氨基酸序列。 1、 API 细菌数值鉴定系统 2、 Enterotube 系统 3、 Biolog 全自动或手动细菌鉴定系统 2、Enterotube 系统 3、Biolog全自动或手动细菌鉴定系统 在96孔的细菌培养板上检测微生物对不同发酵性碳源利用情况进行的分类鉴定。 * * 据保守估计，地球上 真菌约150万种，细菌4万种，病毒130万种 但认识的微生物仅是估计数量的5~10%，即15万~20万种 要认识、研究和利用类群庞大的微生物资源， 必须对它们进行分类。 命名(nomenclature)：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称； 鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。 分类(classification)：根据一定的原则对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定； 种是生物分类中基本的分类单元和分类等级。 微生物的种：指具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其他类群的菌株有很明显的区别。 二、 种（species） 种的具体代表： 称为“模式种”（type species） 例如：抗原特征的差异，分为不同的血清型； 对噬菌体裂解反应的不同，分为不同的噬菌体型 美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey) 主编。 1957年第七版后，吸收了国际上细菌分类学家参加编写，它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的必威体育精装版成果，因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。 第一版（1923年）~ 第八版（1974年） ~ 第九版（1994年） 1984~1989年改为《伯杰氏系统细菌学手册》，简称《系统手