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第6-2 酶
* * 第四节 酶的的作用原理 (一)酶与底物的结合方式 1.中间产物学说 一、酶的专一性及活性部位 2.锁-钥学说 酶(E) 底物(S) E·S 3. 诱导契合学说 S E E S E S (1) 酶有其原来的形状,不一定一开始就是底物的模板。 (2) 底物能诱导酶Pr分子形状发生一定的变化。 (3) 酶分子发生变化后就能与底物互补楔合。 (4) 在酶反应过程中,活性中心构象的变化是可逆的。 (二)活性中心概念: 酶分子上直接参与底物的结合并对其进行催化的区域。 构成:立体结构、其组分的一级结构不连续,如核糖核酸酶活性中心的基团为:His119、His12、 Lys41 基团功能:催化部位 、结合部位 (三)酶活性部位的特点 只是酶分子的一小部分;通过诱导契合形成与底物互补的特定三维结构;通过次级键与底物相互作用;有一定的柔性(邹承鲁的对比研究发现活性部位的柔性比其他部位更强。 二、酶 高效性的 机 理 E +S E?S E ?S* E?P E + P 酶 催 化 过 程 的 构 象 变 化 1. 邻近与定向效应 邻近效应:底物与酶活性中心邻近;底物分子反应基团邻近。 定向效应:活性中心的催化基团须与底物分子的敏感键有合适的位置关系,才易发生催化反应。 邻近与定向的结果:使酶活性部位的底物浓度大大提高。 E S S E 2. 扭曲变形和构象发生变化的催化效应 酶受底物诱导而变形。同时酶使底物中电子云要发生重排,产生电子张力,使敏感键产生“张力”或变形 。 E E S 在这些基团中,咪唑基是最重要的酸碱催化基团,这是因为它在pH时的酸碱强度大,即在生理条件下,一半为酸,一半为碱,第二是释放质子的速度快,其质子结合的半衰期只有10-10秒。 —COOˉ —NH2 —S ˉ —COOH —NH3+ —SH 广义碱性基团(质子受体) 广义酸性基团(质子供体) 3. 酸碱催化: 狭义酸碱:酸 —— H+ 碱 —— OH- 广义酸碱:酸 — 能释放质子的化合物 碱 — 能接受质子的化合物 4. 共价催化:是指酶在催化过程中,酶与底物形成共价中间复合体的催化方式。 酶分子上可以形成这种复合体的基团有两类,即亲核基团和亲电基团。 亲核基团有组氨酸的咪唑基、半胱氨酸的硫氢基、丝氨酸的羟基,另外还有一些辅助因子, 如TPP、CoA等。 亲电基团有金属离子、—NH3+等 底物中的亲电基团包括磷酰基、酰基和糖基。 酶与底物形成共价键的3个例子,其共同特点是酶的亲核中心X进攻底物的亲电中心。 + — 水环境 + — 疏水环境 5. 疏水微环境: 酶在催化过程中,其活性中心为疏水环境,在这种环境中,电荷之间的作用力远远大于高介电环境,大大加强了酶的催化基团与底物分子间的作用力,因而有利于降低反应活化能。有机物的介电常数为7-10,而水的介电常数为80。 反应活化能:酶降低活化能的方式(形成E·S,经历与一般反应不同的途径)如过氧化氢分解,无催化剂时的活化能为75.31KJ/mol,胶态铂催化为46.02KJ/mol,而过氧化氢酶催化为20.92KJ/mol。活化能的降低提高了酶的催化效率。 ? E ? E ? G S P A*(活化态) 反应过程 自由能 6 降低反应活化能 邻近与定向的结果:使酶活性部位的底物浓度大大提高。 底物敏感键扭曲变形结果: 使敏感键变的更为敏感,有利于断裂。 广义酸碱催化结果:为在近中性pH下酸碱催化创造了条件。通过瞬间向反应物提供质子或从反应物接受质子以稳定过渡态。 第五节 多酶体系和调节酶 一 、多酶体系 1、在完整细胞内的某一代谢过程中,由几个酶形成的反应链体系,称为多酶体系。 2、可分为可溶性的、结构化的和在细胞结构上有定位关系的三种类型。 二 、多酶体系的自我调节 代谢过程都是多酶体系的酶促反应,这么复杂互不干扰,又能很有秩序,要有调节,调节方向、快慢,保证生命体正常运转,需要的加快,不需要的减速,受调控。 反应有许多步骤,限速就是最慢的那一步,最终产物抑制或激活限速酶。调节酶主要是别构酶和共价调节酶。 (一)别构酶(allosteric enzyme): 1定义:既有活性中心又有调节部位的酶。 酶 高活性 三、 调节酶类 别构激活剂 S 别构抑制剂 低活性 活性中心 调节中心 2、别构酶的结构特
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