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LAMMPS必威体育精装版稳定版单机并行安装成功教程LAMMPS必威体育精装版稳定版单机并行安装成功教程
LAMMPS 必威体育精装版稳定版单机并行安装成功教程
制作者:zhjs
注:本安装教程采用lammps-10Aug15 这个版本,目前这是官方放出的必威体育精装版的稳定版本,fftw 采用
fftw-3.3.4 这个版本,必威体育精装版版的,mpich 采用必威体育精装版版mpich-3.2,在CentOS 7.0 系统下安装,貌似上面
三个必威体育精装版包有的需要c++11 标准的编译器编译,所以请确保你的机器上已经安装了所需的编译器,
一般用的gnu 编译器版本在4.8.1 及以后的版本都支持c++11 标准,想要查看自己的版本,在终端输
入:
g++ --version
回车,即可看到版本号。
由于安装过程需要root 权限,所以为了方便,请在root 用户下安装。
上述三个安装包可以从CSDN 里下载,有哪些信誉好的足球投注网站:“必威体育精装版稳定版lammps+必威体育精装版fftw+必威体育精装版mpich”
或者自行百度下载。
1. 首先,在/home 文件夹下建立两个文件夹,一个放安装文件(如 software ),另一个作为安装文
件夹(如 vm ),将安装包 lammps, mpich,fftw 放到 software 文件夹下,全部解压。
注意:确保文件夹的名称中没有中文字符,不然很可能会出错
1.1 安装fftw :
进入解压好的fftw 目录下,在终端执行:
./configure --prefix=/home/vm/fftw3 --enable-float
回车 (=号后面是安装路径,这个软件将会安装到 /home/vm/fftw3 这个文件夹下)
执行完成后,再在终端输入:
make
make install
没有出错的话,就安装完成了。。。。。。。。。
1.2 安装mpich:
进入mpich 文件夹下,在终端执行:
./configure --prefix=/home/vm/mpich3 --enable-float
make
make install
1.3 设置环境变量:
进入终端,执行:
cd
vi .bashrc
在打开的文档的最下面添加fftw 和mpich 的lib 路径和bin 路径:
export PATH=/home/vm/mpich3/bin:/home/vm/fftw3/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/vm/mpich3/lib:/home/vm/fftw3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
保存后 (vi 不会使用的自行百度哇),在终端执行:
source .bashrc
echo $PATH
查看刚才的路径有没有添加上。
1.4 mpich 特殊设置:
在终端,执行:
ifconfig -a
将会出现计算机的ip
找到以lo: 开头的那段,下面的inet 后面有一串ip,记下来 (我的是inet 127.0.0.1)
在终端中执行:
vi /etc/hosts
在打开的文档最下面添加:
xxx.xxx.xxx zhjs-pc zhjs-pc
xxx.xxx.xxx 是刚才记录下来的ip,zhjs-pc 是你的计算机的名称
保存。。。。。。
进入 /etc 文件夹下面,在里面创建一个名称为mpd.conf 的空文件,在里面填写上:
MPD_SECRETWORD=mr45-j9z (等号后面的字符串随便写)
保存,然后在终端中给这个文件加上权限:
cd /etc
chmod 600 mpd.conf
完成。。。。。。
测试一下,假如你的系统里有gedit 这个文本编辑软件,进入终端输入:
mpirun –np 2 gedit
如果顺利打开了两个新建文件,则说明配置成功。。。。。。
你也可以用其他软件尝试
1.5 安装lammps:
进入已经解压的lammps 文件夹下,进入src 目录下,然后进入其中的MAKE 文件夹下,里面
有个Makefile.mpi 文件,用文本编辑器打开,修改里面的一些东西:(用颜色显示的表示要修
改的)
# mpi = default MPI compiler, default MPI
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