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氢键准则在DMSO水溶液中应用的评价
物理化学学报(Wuli Huaxue X uebao)
September A cta Phys. -Chim. Sin. 2013, 29 (9), 1891-1899 1891
[Article] doi: 10.3866/PKU.WHXB201307 121
氢键准则在DMSO 水溶液中应用的评价
张 宁 李维仲* 陈 聪 左建国
( 连理工大学, 海洋能源利用与节能教育部重点实验室, 辽宁大连116024)
摘要: 利用分子动力学模拟方法, 分别采用几何准则和能量准则分析了不同浓度下的二甲基亚砜(DMSO)水
溶液的氢键统计和动力学等特性. 结果显示, 两种氢键准则可以很好地反映出溶液的氢键性质随浓度的变化趋
势. 通过分析比较发现, 由于几何准则不能有效地排除具有弱对势能的分子对, 因此其统计的氢键数量要大于
能量准则的结果. 此外, 能量准则对于分子间相对取向的区分存在不足, 进而引起氢键寿命的计算结果偏大. 因
此, 为使氢键分析更加准确, 本文建议使用几何-能量混合型氢键准则.
关键词: 分子动力学模拟; 几何准则; 能量准则; 氢键
中图分类号: O641
Evaluation of the Application of Hydrogen Bonding
Criteria to DMSO Aqueous Solution
ZHANG Ning LI Wei-Zhong* CHEN Cong ZUO Jian-Guo
(Key Laboratory of Ocean Energy Utilization and Energy Conservation of Ministry of Education,
Dalian University of Technology, Dalian 116024, Liaoning Province, P. R. China)
Abstract: Geometric and energetic criteria have been used to analyze the hydrogen bonding statistics
and dynamics of aqueous solutions of dimethylsulfoxide (DMSO) of different concentrations using
molecular dynamics simulation. These two hydrogen bonding criteria both reproduced the changes of the
hydrogen bonding properties of the solutions with increasing concentration. Comparison of the results
obtained using the two criteria revealed that the geometric criterion cannot exclude pairs that have weak
pair interaction energy. As a result, the number of hydrogen bonds determined by the geometric criterion is
larger than that by the energetic criterion. The
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