03分子对接docking.pdf

单击此处编辑母版标题样式 Structural base drug Design: • 单击此处编辑母版文本样式 Molecular Docking • 第二级 • 第三级 吕炜 • 第四级 • 第五级 创腾科技公司 计算机辅助药物设计方法分类 • 基于配体的药物设计策略 -- QSAR -- 药效团 单击此处编辑母版标题样式 • 基于受体的药物设计策略 -- 分子对接 -- 全新药物设计 单击此处编辑母版副标题样式 -- 分子动力学 Structure-Based Drug Design • SBDD：计算机辅助药物设计中最庞大最活跃的研究领域 • SBDD：本质是正确评价靶标与配体之间的相互作用 • SBDD工具： 分子对接 • SBDD应用 单击此处编辑母版标题样式 – 高通量虚拟筛选 – 化合物优化 – 机理研究 单击此处编辑母版副标题样式 什么是分子对接？ 单击此处编辑母版标题样式 单击此处编辑母版副标题样式 分子对接能用来干什么？ 1.研究配体-受体复合物的结 合模式 单击此处编辑母版标题样式 2. 预测受体-配体的结合能力 3. 指导先导化合物的合成改 造和优化 单击此处编辑母版副标题样式 4. 寻找和发现新的先导化合 物 MM－PBSA Scoring应用于Chk1抑制剂正确结合模式的发现 单击此处编辑母版标题样式 单击此处编辑母版副标题样式 ΔΔG= 10.7 Kcal/mol (ε=2) ΔΔG=1.4 Kcal/mol (ε=2) 单击此处编辑母版标题样式 单击此处编辑母版副标题样式 Database(~528439) 单击此处编辑母版标题样式 A known inhibitor was among top 单击此处编辑母版副标题样式 ~0.2% 4425 were ordered (~1%) Active molecule 3169 were tested 单击此处编辑母版标题样式 单击此处编辑母版副标题样式 Active molecule from Active molecule from virtual screen HTS 单击此处编辑母版标题样式 单击此处编辑母版副标题样式 Train