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基因工程3-1 基因操作的工具酶教材课程.ppt
第三章 基因操作的工具酶;3.1 限制性核酸内切酶(restriction endonuclease)
“限制性核酸内切酶” :是一类能够识别双链DNA分子中某种特定的核苷酸序列,并将DNA双链结构切开的核酸内切酶。它们主要是从原核生物中分离纯化到的。
? 限制性核酸内切酶:切割DNA,降解入侵细胞的外源DNA,提供了特殊的重组机会和保卫种的稳定。
? DNA 甲 基 化 酶:修饰DNA(modification),具有种属专一性,通常只修饰宿主本身的DNA,保护其免受降解。
限制酶和甲基化酶对DNA底物有相同的识别序列。 ;3.1.1 分类和命名
分类 :
三类酶均能识别DNA分子中特定的核苷酸序列
? I 型 酶:既有内切酶活性,又有甲基化酶活性(限制-修饰功能);对DNA序列的切割是随机的
? II 型酶:核酸内切酶活性和甲基化酶活性是分开的;切割位点固定,就在特异序列处(在分子克隆中十分有用)
? III型酶:也具有限制-修饰功能;切割位点距特异序列3’-端有24~26 bp的误差;命名 :
(1) 取属名的第一个字母(大写)、种名的前两个字母(小写)组成3个字母的略语,表示产生菌的物种名称
(2) 用罗马数字表示分离到的酶的编号,有时在字母和罗马数字之间还加上一个字母表示菌株的名称(也可以没有)
e.g.:从大肠杆菌RY 13菌株(Escherichia coli RY13)中分离到的第一个限制性核酸内切酶,称为EcoR I
;3.1.2 II型限制性核酸内切酶的基本特征
基本特征:
(1) 作用于双链DNA分子
(2) 能够识别由4~8个核苷酸组成的特定的核苷酸序列——识别序列 或 靶序列
靶序列具有回文结构,也称双重旋转对称结构
如: 或
N代表任意一种核苷酸;EcoR I识别的靶序列为:
;(3) 切割靶序列形成粘性末端或平末端
? 两条链上的断裂位置是处在一个对称结构的中心,结果形成具有平末端的DNA片段。
如Sma I识别的靶序列为:
切割后形成:
;? 两条链上的断裂位置是交错的,但对称地围绕着一个对称轴排列,结果形成具有粘性末端的DNA片段。
“粘性末端”(cohesive end):是指DNA分子在限制酶的作用下形成的具有互补碱基的单链延伸末端结构,它们能够通过互补碱基间的配对而重新环化。粘性末端有两种:
如EcoR I切割后形成:
其单链末端向5’端延伸,称“5’端延伸的粘性末端”。 ; 假定限制位点沿着DNA分子的分布是随机的,则平均每44(即256)个核苷酸出现一个识别4个核苷酸的限制酶(如Sau 3A或Mbo I)的靶序列,而识别6个核苷酸的限制酶(如EcoR I)的靶序列每46(即4096)个核苷酸出现一次。从遗传工程的角度考虑,选用识别序列较长的限制酶可以得到较长的DNA片段。
;?“同裂酶 ”(isoschizomer):来源不同,但可识别同样的DNA靶序列,产生相同粘性末端的一类限制性核酸内切酶,即异源同功酶。
如Sma I和Xma I:
如Mbo I和Sau 3A:
;?“同尾酶 ”(isocaudamer):来源不同,识别的靶序列也不同,但都产生出相同的粘性末端的一类限制性核酸内切酶。
如 BamH I G ?GATCC
Bcl I T ?GATCA
Bgl II A ?GATCT
Sau 3A ?GATC
Xho II U ?GATCY (U:嘌呤,Y:嘧啶)
都形成由GATC四个核苷酸组成的粘性末端。 ; 由同尾酶所产生的DNA片段,能够通过其粘性末端之间的互补作用而彼此连接起来,所以在基因操作中很有用处。但必须注意,由两种同尾酶消化而产生的粘性末端,重组之后所形成的序列结构不能再被原来的任何一种同尾酶所识别。
如:
; 限制性核酸内切酶识别的靶序列同DNA的来源无关,原则上任何不同来源的DNA,经过适当限制酶的处理之后,可以通过其粘性末端或平末端连接起来。这种特性是重组DNA的重要基础之一。 ;条件
; ? 一个限制性核酸内切酶活力单位定义为:
在建议使用的缓冲液及温度下,在20 ?L反应液中反应1 h,使1 ?g DNA完全消化所需要的酶量。 ;3.1.3.2 反应的操作步骤
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